- YMCA v České republice
- Yale Model Government Europe CZ, o. s.
- Yacht Club Lipno nad Vltavou, z.s.
- Yacht club ANCORA
- Yerlango o.s.
- Yacht klub Strážnice, z.s.
- Yoshinkan Nové Město nad Metují, z.s.
- Youth Included, z. s.
- YMCA Pelhřimov, z. s.
- YACHT CLUB RAZOVÁ z. s.
- YACHT KLUB JESENICE z.s.
- YAKSHA GYM PLZEŇ z.s.
- Yankee and Confederate Artillery Club Y.A.K.A.C.
- Yacht Club Solenice, z. s.
- YARD RESORT, z.s.
- Yacht klub Mělník z.s.
- YACET-MLÁDEŽ, UMĚNÍ A KREATIVITA V EVROPĚ
- Yoga Slavičín, z.s.
- YOUTH ROMA PARLIAMENT, z. s. v likvidaci
- YachtClub Dyje z.s.
- YROBAT z.s.
- YMCA Hradec Králové
- YMCA Praha
- YESYES z.s.
- YMCA Neveklov "v likvidaci"
- YMCA Olomouc
- YCO - Yacht Club Ohrada, z.s.
- Yacht club Letovice
- YOUR FREESTYLE ACADEMY z.s.
- YACHT CLUB SILŮVKY, z.s.
- Yacht Club PARS, z.s.
- yo-yo, z. s.
- YACHT KLUB ORLÍK - BOR z.s.
- Young Golf Champions z.s.
- YAD Albert z.s.
- YFU CZ, z.s.
- Yacht klub Jestřábí, z.s.
- Yukiyama dojo, z. s.
- Young Glass Symposium z.s.
- Youth for Youth, z.s.
- Young Czech Arbitration Professionals, z.s.
- Yogadana, z.s.
- Yoga Experience Center, z.s.
- Yacht Club Bohemia o.s.
- Yacht club ČSA, v likvidaci
- YMCA Třebechovice
- YACHT CLUB MILEVSKO z.s.
- YogafestZLÍN z.s.
- Yvontek, z.s. v likvidaci
- YWAM ČR z.s.