- YARD RESORT, z.s.
- Yacht klub Junior Praha
- Young Riders & Horses z.s.
- Yacht Club ROSO Břevnov v likvidaci
- YOUTH ROMA PARLIAMENT, z. s. v likvidaci
- YPO Czech Chapter z. s.
- Yoga Ostrava, z.s.
- YMCA Husinec
- Yacht klub J.J.J., z.s.
- YOUNGTIMER CLASSIC SPORT CARS CLUB, o.s.
- YMCA Setkání
- YACHT CLUB A.N.V.
- Youth4Ova, z.s.
- YORE - Občanské sdružení přátel historie
- Yacht club ČSA, v likvidaci
- Yvontek, z.s. v likvidaci
- Yacht Club Kotva Praha, z.s.
- Yale Model Government Europe CZ, o. s.
- Yacht Club DRAGON 77
- YCR - Jachting Roudnice nad Labem, z.s.
- Yoshinkan Nové Město nad Metují, z.s.
- Yankee and Confederate Artillery Club Y.A.K.A.C.
- Yacht club UNICORN, z. s.
- YACHT CLUB PŘÍBRAM, z.s.
- YMCA - Živá rodina
- Yacht klub Jestřábí, z.s.
- Youth z.s.
- Yes z.s.
- YWCA v České republice v likvidaci
- Yacht Club Slezan Opava, z.s.
- YACHTCLUB PETROV z.s., v likvidaci
- Yacht club Vranovská přehrada z.s.
- YMCA Olomouc
- Yukiyama dojo, z. s.
- YMPAL- SPORT, o.s.
- YMCA Plzeň, z. s.
- Youthink z.s. v likvidaci
- YMCA Hradec Králové
- YOUNGTIMER - Česká republika, z.s.
- Ynnovations - Institut pro znalostní společnost v likvidaci
- Youth Europa Czechia z.s.
- Yacht Club Kovářov z.s.
- Yacht Club Řež z.s.
- YC PanCzech, z.s.
- YACHT CLUB Vysoké Mýto z.s.
- YACHTCLUB BANÍK OSTRAVA
- YWAM ČR z.s.
- Yacht club Krnov z.s.
- Young Planeswalkers
- Yoga retreat club z.s.