- Youth in Czech Republic, z.s.
- Yacht club Lipno z.s.
- Yacht Club ROLLING BOTTLES, z.s.
- YMCA Nejdek
- Youthink z.s. v likvidaci
- Youth Business Network
- YACHTCLUB PETROV z.s., v likvidaci
- YogafestZLÍN z.s.
- YC PanCzech, z.s.
- Yankee and Confederate Artillery Club Y.A.K.A.C.
- Yacht Club Lipno nad Vltavou, z.s.
- Yorkshire Terrier klub chovatelů a jeho přátel, z.s.
- YAMAHA TEAM Petr Kalášek z.s. v likvidaci
- Yale Model Government Europe CZ, o. s.
- Yetti Club Trutnov z. s.
- YMCA Plzeň, z. s.
- YACHTCLUB PASOHLÁVKY z. s.
- Yacht Club Rabyně-Babor v likvidaci
- Yacht Club BER Slezská Harta o.s.
- Yacht Club Staré Město Praha, z.s.
- YEAH, z.s.
- YMCA Brno
- YARD RESORT, z.s.
- Youth and Environment Europe Czech Republic
- YACHT CLUB Vysoké Mýto z.s.
- YACHT CLUB KOLODĚJE
- Yacht Club ROSO Břevnov v likvidaci
- YACHT CLUB MEZ VSETÍN, z.s.
- YC CoolStar, z.s.
- Yacht club Znojmo, z.s.
- YACHT CLUB Dvořiště - Lišov, z.s.
- YOUnique z.s.
- Yacht Club Kovářov z.s.
- YORE - Občanské sdružení přátel historie
- YWAM ČR z.s.
- YFU CZ, z.s.
- Young Leaders CZ z.s.
- YOUNGTIMER - Česká republika, z.s.
- Yogadana, z.s.
- YACHTGROUP.CZ
- Y - Open, z.s.
- You can do it!, z.s.
- YMCA DAP
- Youth Europa Czechia z.s.
- Yacht Club Actinet v likvidaci
- Yoshinkan Nové Město nad Metují, z.s.
- YMCA Ústí nad Labem
- YMCA Orlová
- YC GRAF o.s. v likvidaci
- Yellow Hills z. s.