- ŠFL Kladno, z. s.
- Šifra Media Klub, z. s.
- Šohajíček, z. s.
- Školička Koťata o.s., v likvidaci
- Šťastný rodič, šťastné dítě, z.s.
- Šarpej v nouzi, z.s.
- ŠÍPÁČEK Ostrava z.s.
- Šachový spolek Znojmo
- Šipkařský klub DC McPuppin´s, z. s.
- Škola bojových umění SAKURAI
- Školní spolek Komenský, z.s.
- Šatník Hradec z. s.
- Školská ombuds platforma, z. s.
- Šachový klub Černovice, v likvidaci
- ŠK Caissa Třebíč z.s.
- ŠKOLA PŘÍRODNÍHO LÉČENÍ TILIA, z.s.
- ŠK Kapličák Liberec, spolek
- Školička DENEVIENS, z.s.
- Škoda veteran car club Brno, z.s.
- Šuba Duba Band
- ŠEDLO, v likvidaci
- Školní sportovní klub při základní škole
- Škola plná pohybu, spolek
- ŠTJ Mládí Brno z. s.
- Šumavské dědictví a budoucnost, z.s.
- Šakti, z.s.
- Školní rada, z. s.
- Šťastný domov - charitativní nezisková organizace, z. s.
- Škola dětí a mládeže z. s.
- Šuplík, z.s.
- Šachový klub Štěchovice
- Štěpánovské okrašlovaci spolek, z. s.
- ŠACHTA UK z. s.
- Šachklub Karbo Benátky nad Jizerou, z.s.
- Šermířské a divadelní sdružení GLADIUS z.s.
- Škola umění v Měříně, z. s.
- Štítary pro děti, z. s.
- ŠROUBKY A MATIČKY, z.s.
- ŠNEK - Klub pohybu v obci o.s., v likvidaci
- Šipkařský klub Baník Kobylka z.s.
- Šachový klub Aurora - šachová škola Anatolije Karpova z.s.
- Šafrán o.s.
- Šipkový klub Chornice
- ŠPRTEC ŽABOVŘESKY z.s.
- ŠOTOKAN KARATE MIMOŇ
- Štěpánkovický ochotnický spolek
- Švihadlo, z. s.
- Šumperský pohár horských kol
- ŠIFO Plzeň
- Štítarský SK, z.s.