- International Scientific Institute, z.s.
- Institut pro vědecký výzkum vývoje ve východní Evropě v likvidaci
- Informační fórum Evropa bez bloků v likvidaci
- Institut pro křesťanskou kulturu, spolek
- INTERNATIONAL BUDO FEDERATION CZECH REPUBLIC v likvidaci
- Institut klasické kytary
- IŠTAR
- Iglue
- Institut komunitního rozvoje, z.s.
- International Consulting&Research Association z.s.
- International Press Club of Prague-Czech Republic (Internacionální tiskový klub v Praze-Česká republika)
- Inter Čechie Litvínov-garda 1968
- INDUSTRY CLUSTER 4.0, z. s.
- I. Městský golfový klub Nový Jičín "v likvidaci", z.s.
- Institut domácí péče o.s.
- Institut kognitivně behaviorální terapie (IKBT) z.s.
- Infoport v likvidaci
- Institut Livingston, z.s.
- Instruktoři Brno, z. s.
- IKBT 17. výcviková skupina z.s.
- Intercoolcom, z.s.
- Institut kvality sociálních služeb, z.s.
- IN LIFE, z.s.
- InBáze, z. s.
- INF nord, z.s.
- INWAZE
- Inventura, z.s.
- INTERA, z.s.
- International Kennel Club, z.s.
- ITAKAL.CZ, z.s., v likvidaci
- IRIL
- Iglou, z.s.
- Imcuber, z.s.
- INTEGRA HELP CENTER z.s.
- International Machine Design Association, z. s.
- Institut "SINE COOPERANTE NULLA VITA", z.s.
- Impro FrMol z.s.
- Inter Hošťka, z.s.
- Innovation Tank
- INFUN be FUN z.s.
- IPSC .45 Brno, z.s.
- IWATC z. s.
- Iniciativa STOP, občanské sdružení
- Insala z.s.
- Institut pro politiku a společnost, z.s.
- inkonTY, z.s.
- IVVA - Veteran Volleyball z.s.
- Institut dětí a mládeže České Budějovice, z.s.
- Institut pro rozvoj sociální ekonomiky z.s.
- Institut environmentálního a etického vzdělávání, z.s.