- Institut "SINE COOPERANTE NULLA VITA", z.s.
- ISSIMA
- Italský vzdělávací institut z.s.
- I. USP Slamník Vršovice 1972 v likvidaci
- Iluze klub Brno, o.s.
- Inside Film z.s.
- Iniciativa Tuchoměřice, o.s., v likvidaci
- Informace pro všechny, z.s.
- Iniciativa za bezpečnost silničního provozu, z.s.
- Institut živé filosofie z. s.
- Institut prevence, z. s.
- I dream about beauty
- Inferno v likvidaci
- Independent Media Club, z.s.
- iNquinity o.s.
- Institut pro záchranu památek, z.s.
- In Spin, z.s.
- Institut pro sociální politiku
- iKnow Club
- Institut interiérových designérů, z.s.
- Institut rodinné terapie Praha v likvidaci
- Institut pro správné praxe z.s.
- Institut zážitkové pedagogiky
- Integrace a rovné příležitosti, z. s.
- International Martinů Circle, z. s.
- In Nomine Bohemia z.s.
- INTER-KONTAKT-GRAFIK, občanské sdružení, v likvidaci
- Ičy & Skrečy z.s.
- IP - SPORT
- INSPIRO
- IURS - Institut pro udržitelný rozvoj sídel z.s.
- Iniciativa Nové odbory, z.s.
- Institut pro supervizi, evaluaci a vzdělávání v likvidaci
- Institut Eduarda a Martina Petišky, z. s.
- International Building Performance Simulation Association Czech
- Implantologický klub ČR
- INNA z.s. Havířov onkologická organizace
- IZAN o.s.
- Informační středisko mírových skupin v likvidaci
- International School of Healing Arts, z.s.
- iJihlava.cz, z.s.
- INTER TV HUMANITARIAN ORGANIZATION CZECH REPUBLIC o.s.
- ICEO o. s.
- ISTRO CZ, z.s.
- INFO Centrum DRAČICE z.s.
- Institut vzdělávání a rozvoje, z. s.
- Institut politického marketingu, z.s.
- Ichtys bohemica, o.s.
- IV. odboj z.s.
- IMPULS z.s.