- iZahrádka z. s.
- Incoforum z.s.
- Institute of the Chamber of Commerce z.s. v likvidaci
- International Police Association - sekce Česká republika z.s.
- Iniciativa NE!, občanské sdružení
- Interpersonal factors
- I.ČESKÝ SPOLEK RAKOUSKO-UHERSKÝCH OSTROSTŘELCŮ
- IPMS Česká republika - Praha, z.s.
- Intercoolcom, z.s.
- Idealisté.cz, z.s.
- iKnow Club
- Institut psychologie písma, z.s.
- INI Project, z.s.
- INTERNATIONAL FUTSAL CLUB, z.s.
- inkonTY, z.s.
- Institut pro sociální politiku
- Iniciativa Občanského Bezpečí Domova, z.s.
- Izvěsti
- Institut veřejného vzdělávání EDUCATE
- IBK KOMETA BRNO o.s.
- IN Club, z.s.
- INVEST IN BRAVERY GLOBAL z.s.
- IDEM PER IDEM (I.P.I.), v likvidaci
- IHC Chemipro Chrudim z.s.
- Informační centrum rodičů a přátel sluchově postižených, z.s.
- INDONÉSKO-ČESKÁ OBCHODNÍ A KULTURNÍ KOMORA, z.s.
- Indiánský klub Vlčí totem
- Internacionálové Slovácká Slávia z.s.
- IDENTITY WS club Nechra z.s.
- Institut plemenářství skotu Angus, z.s.
- Investiční rodinný spolek z.s.
- International Science and Engineering Society, z.s.
- iProtect z.s.
- IT Klub z.s.
- INTER-KONTAKT-GRAFIK, občanské sdružení, v likvidaci
- INTERNET PRO NAŠE DĚTI
- IHC Olomouc Eagles, z.s.
- ITS Tennis Club, z.s.
- Institut výzkumu funkce lesa z.s.
- Israeli Tactical And Combat System - Třebíč, z.s.
- Institut informačního desingu
- Imobilus, z.s.
- Inter-regio marketingový klub, z. s.
- ic-net v likvidaci
- Iron Cavalry LE MC, z.s.
- Institut kognitivně behaviorální terapie (IKBT) z.s.
- Intonic, z. s.
- IPC Motion, z.s. v likvidaci
- Institut pro občanskou a náboženskou svobodu, z. s.
- ILCO Cheb, z.s.