- International Development and Equality Alliance z.s.
- I. ČLTK Plzeň, z.s.
- INTERPONS v likvidaci
- International Association for Managers Potential, z.s.
- IVVA - Veteran Volleyball z.s.
- IN, z. s.
- Iniciativa Romů Restart , z.s.
- International Health Coaching Association (IHCA), z.s.
- Institut pro média a data, o.s.
- Institut pro sociální politiku
- Indian Corral Westerners International z.s.
- Institute of TOG z. s.
- ICYB - International Centre for Young Beekeepers, z.s.
- Institut kariéry a rozvoje, z. s. v likvidaci
- Instruktoři Brno, z. s.
- Ignisio z.s.
- IPS z. s.
- Isshinkan Hradec Králové, z.s.
- Internet pro Nišovice, z.s.
- ISP net global, o.s.
- INSTITUT AK, z. s.
- Institut pro vědecký výzkum vývoje ve východní Evropě v likvidaci
- Independent Media Club, z.s.
- International salling club, v likvidaci
- Institut pro rozvoj sociální ekonomiky z.s.
- INTEGRITY 2000
- Integrace v Mateřské škole Staňkova 14
- Iniciativa 2023, z. s.
- Idea Boom, o.s.
- IPMS Czech Republic,o.s. v likvidaci
- Israeli Tactical And Combat System - Třebíč, z.s.
- IVZ - Institut pro vzdělávání a sociální začleňování, z. s.
- IPMA Česká republika, z. s.
- Institute for Modern Development, z.s.
- Inside Film z.s.
- InBáze, z. s.
- Institut spolkových práv
- INTROPE z.s.
- Inter Hošťka, z.s.
- IT Insurance Alliance
- IHC REFLEX UHERSKÉ HRADIŠTĚ
- INTERLUDIUM v likvidaci
- International Science and Engineering Society, z.s.
- Institut pro podporu systemického řízení organizací
- Institut rodin
- Innovation Tank
- In & Ex design, z.s.
- ILL Fish z.s.
- Institut Eduarda a Martina Petišky, z. s.
- ISKCON v likvidaci