- INSTITUT INSTITUT, z.s.
- INVEST IN BRAVERY, z.s.
- IHC Prague Rats, z.s.
- International Society for Academic Studies, z. s.
- Indigo Děčín, z.s.
- Inner Peace z.s.
- Institut bezpečnosti práce o.s.
- Iuvamus, z. s.
- Industrial Ostrava, z.s. "v likvidaci"
- Institut mediální gramotnosti, z. s. v likvidaci
- INVOSERVIS Brno, v likvidaci
- Institut pro rozvoj české vědy v likvidaci
- INTUITIVNÍ PEDAGOGIKA z.s.
- Institut rodinné terapie Praha v likvidaci
- INFO KULTUR
- Institut systemického koučování v likvidaci
- Iniciativa spolků vojenské historie České republiky, z.s.
- International Fiscal Association, Česká republika
- I.S.F. o.s.
- Integrace a rovné příležitosti, z. s.
- INTBAU Czechia, z.s.
- International Student Network z. s.
- In The Country Aš
- INTERVIA, ústecký klub na podporu mezinárodních kontaktů dětí a mládeže
- Independent Order of Odd Fellows-Dorothea lóže č.5, z.s.
- Internetové Projekty, o.s. "v likvidaci"
- Institut film a společnost z.s.
- Ingejáni, v likvidaci
- Inter Club Praha z.s.
- International Youth Cooperation Czech Republic, z.s.
- INTER Břeclav v likvidaci
- Isysport Praha v likvidaci
- iLikeSharePoint
- Inline Hockey Club, zapsaný spolek
- ITA-SKI CLUB z.s.
- iDobříšsko.cz, z. s.
- Iktočante Holešov, z. s.
- IVVA - Veteran Volleyball z.s.
- Indonéská společnost v Československu, v likvidaci
- Integrační sportovní klub IFC z. s.
- IMUNÍCI, z.s.
- Iniciativa Hlavák, z.s.
- Institut pro rozvoj sociální ekonomiky z.s.
- Integrační centrum CEDA, z.s.
- Isara, z.s.
- Institut vzdělání a výzkumu v AAS, z. s.
- Iniciativa Tuchoměřice, o.s., v likvidaci
- IMAPS - mezinárodní společnost pro mikroelektroniku a pouzdření IMAPS, z.s.
- In-Line hokejový klub Outsiders Pardubice o.s.
- In Motion z. s.