- Institut pro rozvoj kynologie
- iShorts, z.s.
- ISIS - občanské sdružení pro pomoc náhradním rodinám, z. s.
- Inter Club Praha z.s.
- Institut pomoci při poškození mozku, z. s.
- Inspiro-agentura z.s.
- Institut Neslyšících pro specializované vzdělávání, o. s.
- ic-net v likvidaci
- International Scientific Association Kepler z.s.
- Integrační sportovní klub IFC z. s.
- INVICTUS TEAM SPORT, z. s.
- INFORM klub Chomutov
- International Gold Event 2017, z. s.
- Information Society for Equal Chance, v likvidaci
- Inclusive Future z.s.
- In Spin, z.s.
- INTEGRITA-CZ
- INVOS, v likvidaci
- Institut pro supervizi, evaluaci a vzdělávání v likvidaci
- INTERA, z.s.
- INCAM CONTROLS z.s.
- INTERNATIONAL ELITE ALLIANCE z.s.
- INCUREGO
- IPPON KARATE KLUB SHOTOKAN BEROUN, z.s.
- Institut aplikovaného výzkumu z.s.
- IT potřebným o.s.
- Indoor Sport Klub Karlovy Vary o.s.
- Institut pro vzdělávání a asimilaci, z.s.
- INICIATIVA BULHAR, z.s.
- I.H.S. - Česká republika v likvidaci
- Institut Didaktik, o.s.
- INSPIRACE Slavonice, z. s.
- Israeli Tactical And Combat System - Třebíč, z.s.
- Institut environmentálního a etického vzdělávání, z.s.
- IdeaZone, z.s.
- IKV - LepšíNet z.s.
- itSMF Czech Republic, z.s.
- Investice a Development Ústeckého kraje, z.s.
- Institut českého venkova z.s.
- Isis help
- iJihlava.cz, z.s.
- INTERNATIONAL FUTSAL CLUB, z.s.
- Iktočante Holešov, z. s.
- Institut rodinné terapie Praha v likvidaci
- Institut pro restorativní justici, z.s.
- Informační média Česká Republika, z. s. v likvidaci
- Iniciativa 2023, z. s.
- Interliga Dobříš v likvidaci
- IBOS RACING TEAM,o.s.
- Institut pohostinného přátelství z.s.