- International Society for Glucan Research, z.s. v likvidaci
- ISŠ-FIT klub Havířov
- Internetový institut z. s.
- ILL Fish z.s.
- Institut historie informačních technologií, z.s.
- IMT - Institut pro mysl a tělo z. s.
- Institute of Social Investigative Studies, z. s.
- Institut pro podporu výchovně-vzdělávacích pracovníků (IVP), v likvidaci
- IPPON KARATE KLUB SHOTOKAN z.s.
- In nostrum posterus, z.s.
- ISIS-system
- iNquinity o.s.
- Institut rozvoje Krajské hospodářské komory StČ, z.s.
- Isis help
- Institut aktivního občanství, z.s.
- Intelsport, z.s.
- Institut pro záchranu památek, z.s.
- Institut zdravé výživy v likvidaci
- Institut prevence, z. s.
- Institut klinické psychologie z.s.
- INTERDOG BOHEMIA - kynologický spolek
- inteRaction e-sports club v likvidaci
- I.S.I.S. - The International Soul of Individual Sports z.s.
- Iniciativa Benice 2019 z.s.
- IHC REFLEX UHERSKÉ HRADIŠTĚ
- IVVA - Veteran Volleyball z.s.
- Internet Havířov z. s.
- Indian Community in Czech Republic z. s.
- ISEA - Institut pro sociální a ekonomické analýzy, z.s.
- IURS - Institut pro udržitelný rozvoj sídel z.s.
- Iron Branch, z. s.
- Institute for Modern Development, z.s.
- Inkluzion, z. s.
- I. CHODSKÝ TRIATLONOVÝ KLUB
- Integrum, z.s.
- Institut pro vzdělávání a asimilaci, z.s.
- Informační centrum prevence a boje proti AIDS Prostějov v likvidaci
- Intercup Zlín, spolek
- II Dolcimelo
- INFORMAČNÍ CENTRUM PRO MLÁDEŽ TÁBOR, z.s.
- Institut Krista Velekněze, z.s.
- Institut vzdělání a výzkumu v AAS, z. s.
- Institut pro studium ekonomiky a politiky, z.s.
- IJP motocross team
- Integrace 2.0
- Institut pro středoevropskou kulturu a politiku
- IN LINE KLUB - PROSTĚJOV
- IGS Agency, z.s.
- IBK Tajula, z.s.
- Inline Hockey Club, zapsaný spolek