- In-Move z.s.
- IBK Falcons Šternberk
- Integra - spolek pomoci migrantům
- Implantologický klub ČR
- Iglue
- ISA - International Skating Academy, z.s.
- Institut přírodní medicíny
- IHC Rebels Polička, z.s.
- Informační centrum životního prostředí Třebíč
- International Health Coaching Association (IHCA), z.s.
- IPUP, z. s.
- iJihlava.cz, z.s.
- Iktočante Holešov, z. s.
- Institut práva a občanských svobod, z. s.
- ILCO Cheb, z.s.
- IHC Olomouc Eagles, z.s.
- Intellectual Capital Investment Association, z.s.
- Institut prostorové orientace, z.s.
- In-line klub, z. s.
- Infoscience, z.s.
- Institut mediální tvorby, z. s.
- IM READY, z.s.
- Iniciativa NE!, občanské sdružení
- I. Sbor vojenských záložníků Československé republiky v likvidaci
- Ingejáni, v likvidaci
- INVOS, v likvidaci
- Informační centrum Aloise Háby v likvidaci
- Inspirace Zlín z.s.
- International Federation of Palynological Societies
- Institut terapie zaměřené na emoce, z. s.
- Institut pro vědecký výzkum vývoje ve východní Evropě v likvidaci
- Institut aktivní politiky zaměstnanosti
- Inženýrské a projektové služby pro stavebnictví Čes.Budějovice
- Internetová komunikace, o.s.
- Institut nesvobody, z.s.
- INICIATIVA BULHAR, z.s.
- Institut politického marketingu, z.s.
- INSTITUT LESNÍ KULTURY, z.s.
- IR Teutschmeister 1757 o.s.
- Informace pro všechny, z.s.
- Immanuel, z. s.
- Institut environmentálního a etického vzdělávání, z.s.
- Internet pro Nišovice, z.s.
- Inženýrská akademie České republiky, z.s.
- Iniciativa 2023, z. s.
- Internet peering center o.s.
- ICE SPEEDWAY CLUB Přelouč
- iChange, z.s.
- IFAS Pardubice, z. s.
- In Infinitum, o.s.