- Institut Aleny Vitáskové z.s.
- ICS 2000
- International Association for Managers Potential, z.s.
- International School of Healing Arts, z.s.
- INSPIRIA o.s. v likvidaci
- iJihlava.cz, z.s.
- ISCA z.s.
- Institut mobility, o.s.
- Institut rodinné terapie Praha v likvidaci
- Informační centrum veřejného sektoru v likvidaci
- IQčko z.s.
- Ichtys bohemica, o.s.
- Institut mezioborových studií, spolek v likvidaci
- Independent Order of Odd-Fellows BOHEMIA LOGE No.l
- Indiáni z Krkonoš, z. s.
- IUVENTA, spolek umělecky nadaných dětí a mládeže, z.s.
- INFORMAČNÍ CENTRUM MIR MEDJUGORJE-ČESKÁ REPUBLIKA, z.s.
- ISIS - občanské sdružení pro pomoc náhradním rodinám, z. s.
- Iniciativa Pivoňka, z.s.
- In-line hokejový spolek Uh.Brod
- Iter Nostrum z.s.
- Institut komparativních politických studií v likvidaci
- ITS Tennis Club, z.s.
- Institut terapie zaměřené na emoce, z. s.
- In Aspectu, z. s.
- Institut sociálních hnutí
- Indoma Štětovice z.s.
- IT EDUCATION o.s. v likvidaci
- Informační centrum Kavkaz - Východní Evropa z.s.
- Iktočante Holešov, z. s.
- Intercoolcom, z.s.
- Institut Eko Art, z.s.
- INTROPE z.s.
- INSTITUT AK, z. s.
- Institut pro etické poradenství ve zdravotnictví z. s.
- IQRF Alliance z.s.
- ISACHAR, z. s.
- Institut pro podporu systemického řízení organizací
- Institut cestovního ruchu a vzdělávání, z. s.
- Institut pro samosprávu a venkov, z. s.
- Integrační centrum BALTAZAR, z.s.
- Institut tržního urbanismu, z.s.
- irontime z. s.
- ISTROPOLIS
- Institut pro výzkum špatné reklamy
- Institute of Social Investigative Studies, z. s.
- INCAM CONTROLS z.s.
- Internacionálové Slovácká Slávia z.s.
- I-AME z.s.
- Institut bezpečné dopravy, z.s.