- Institut sociální a kulturní antropologie medicíny
- Implantologický klub ČR
- Independent Order of Odd Fellows-Dorothea lóže č.5, z.s.
- INFORMAČNÍ CENTRUM MIR MEDJUGORJE-ČESKÁ REPUBLIKA, z.s.
- Inter Allied, o.s.
- in.dust, občanské sdružení
- IQčko z.s.
- IC Petrovice u Karviné, z.s.
- INLINE HOCKEY CLUB PÍSEK z.s.
- INS BIKE TEAM z.s.
- International Veterinary Students´ Association Brno
- IRON BIKERS v likvidaci
- IZAN o.s.
- Internetové Projekty, o.s. "v likvidaci"
- Independent Order of Odd Fellows-CONCORDIA LOGE No.2 v likvidaci
- International Society for Surface Science
- Improve Yourself, z. s.
- I.H.S. - Česká republika v likvidaci
- IBK Kubánský Klan, z.s.
- Institute for Modern Development, z.s.
- Iniciativa Martina Konvičky z.s.,
- InBáze, z. s.
- Infoport v likvidaci
- Indian Community in Czech Republic z. s.
- ISHA Olomouc z.s.
- International Sport Fighting Association, z.s.
- Integrace s charitou, občanské sdružení
- Institut vzdělávání a regionálního rozvoje, z. s.
- INVEST IN BRAVERY, z.s.
- Institut přírodní medicíny
- Inferno v likvidaci
- Institut pomoci při poškození mozku, z. s.
- Iron Cavalry LE MC, z.s.
- INNA z.s. Havířov onkologická organizace
- Intuiti Group z.s.
- Institut pro restorativní justici, z.s.
- IŠTAR
- International Geosynthetics Society - Česká republika z.s.
- International Felinotherapy Association, z. s.
- Institut pro záchranu památek, z.s.
- Informační a publikační centrum ALARM
- Institut pro vysokou citlivost, z. s.
- INTERNATIONAL GSPORT FEDERATION z.s.
- IMUNÍCI, z.s.
- Institut amatérského výtvarného umění o.s.
- Information & Playing Club v likvidaci
- IASKA-ČSFR
- INFOCENTRUM Dobřichovice, z. s.
- IDI - Institute for Democratic Iniciatives, z. s.
- Institut medicínské právní ochrany zdravotníků