- I. Královský lukostřelecký klub z.s.
- INTER MEDIA z.s.
- iJihlava.cz, z.s.
- INCUREGO
- Independance Vyšehrad, z.s.
- IKS Racing z.s.
- IMT - Institut pro mysl a tělo z. s.
- Institut Williama Wilberforce, z. s.
- In The Country Aš
- INTER-TIR, Spolek podnikatelů v silniční dopravě
- Institut tradiční výroby pečiva, z.s.
- International Machine Design Association, z. s.
- Iniciativa za živý venkov, o.s.
- IURS - Institut pro udržitelný rozvoj sídel z.s.
- Iniciativa pro evropské hodnoty z.s. v likvidaci
- IURI AUGENDO
- Idea Boom, o.s.
- InREGIO o.s.
- IWATC z. s.
- IDEUM & ART z. s.
- IRIL
- INDEPENDENT, o.s.
- International Students Medical Association in Pilsen - ISMAP o.s.
- Iniciativa Nové odbory, z.s.
- Institut pomoci rodičům samoživitelům, z. s.
- iv 1210, z.s.
- Institut pro evropskou politiku EUROPEUM, z.s.
- Institut pro studium života a díla Sherlocka Holmese z.s.
- Infinitum z.s. "v likvidaci"
- Iniciativa pro svobodnou Sýrii
- Institut pro občanskou a náboženskou svobodu, z. s.
- INSTITUT PRÁVA A SOUDNICTVÍ
- II.Chance
- itSMF Czech Republic, z.s.
- IRON-STONE FREERIDE
- IFFD Czech Republic, z.s.
- International Development and Equality Alliance z.s.
- Imobilus, z.s.
- IDEM PER IDEM (I.P.I.), v likvidaci
- I. CZ Yorkshire terrier club, z.s.
- IZZ.CZ z. s.
- Institut sociálního bydlení, z.s.
- INTERA, z.s.
- I. Karambol klub Chomutov
- Institut amatérského výtvarného umění o.s.
- Institut aplikovaného výzkumu z.s.
- Integrační centrum BALTAZAR, z.s.
- Institut bezpečné dopravy, z.s.
- International Sauna Club v likvidaci
- I. USP Slamník Vršovice 1972 v likvidaci