- Institut pro evropské záležitosti, o. s.
- IT PC Help z. s.
- IŠTAR
- International Society for Academic Studies, z. s.
- Institut Gustava Mahlera, z.s.
- IPUP, z. s.
- ISLÁMSKÉ CENTRUM V ČESKÉ REPUBLICE v likvidaci
- Immanuel, z. s.
- International Sauna Club v likvidaci
- Institut pro středoevropskou kulturu a politiku
- Indoma Štětovice z.s.
- Intercup Zlín, spolek
- Iniciativa Pivoňka, z.s.
- Inside Film z.s.
- INTERMAPS z.s.
- In-line klub, z. s.
- IMAPS - mezinárodní společnost pro mikroelektroniku a pouzdření IMAPS, z.s.
- ITAKAL.CZ, z.s., v likvidaci
- INFUN be FUN z.s.
- Institut tradiční výroby pečiva, z.s.
- Integrační Klub Česko-Moldavského Přátelství "Zimbru Olymp" z.s.
- Institut nesvobody, z.s.
- Iniciativa Dokořán, z. s.
- Ichtys bohemica, o.s.
- Iuriscon
- Institut Williama Wilberforce, z. s.
- ICT klastr z.s.
- INVICTUM-PLZEŇ
- Institut dětí a mládeže Praha 3, z. s.
- INSTITUT EVROPSKÝCH PORADCŮ, o.s.
- Institut klasické kytary
- Iniciativa "Za dodržování zákona" v likvidaci
- IN-LIFE cycling team, z.s.
- IN TIME
- Informační média Česká Republika, z. s. v likvidaci
- Information Society for Equal Chance, v likvidaci
- Inspiration company, o. s. v likvidaci
- I.V.M., z.s.
- International Golf Fellowship of Rotarians Europe, z.s.
- In Spin, z.s.
- iVltava.cz
- Institut Puls, z.s.
- Irácké forum v ČR, z.s.
- ISIS
- Institut duchovního doprovázení, z. s.
- Informační technologie z. s.
- iNquinity o.s.
- Improve Yourself, z. s.
- In-Move z.s.
- ISIDA AMENTI