- INCOGNITI z.s.
- INSIEME, z.s.
- INSPORT Tři Studně z.s.
- II. TURNUS z.s.
- Institut prostorové orientace, z.s.
- IQ Roma servis, z.s.
- Inspirativa, o.s.
- Institut pro sociální politiku
- International Ensemble, z.s.
- Infanterie Regiment No.74 v likvidaci
- Isshinkan Hradec Králové, z.s.
- INTERVIA, ústecký klub na podporu mezinárodních kontaktů dětí a mládeže
- Institut pro analýzy vysokého školství, o. s.
- Insala z.s.
- ILMA z.s.
- Institut Virtuálního Soukromí, z.s.
- Iniciativa Park
- International Scientific Institute, z.s.
- Institut historie informačních technologií, z.s.
- Infoscience, z.s.
- Iniciativa pro efektivní zdravotnictví, z.s.
- Iniciativa Tuchoměřice, o.s., v likvidaci
- Inteiv, z. s.
- In Aqua Sanitas z.s.
- IPRK, z.s.
- Inomaker, z.s.
- Iglauer Regionalkulturverband, o.s. - v likvidaci
- Integrace a rovné příležitosti, z. s.
- Integrace 3P, z.s.
- ILH Teplice O.S.
- Infinity Dance Team z.s.
- International Gender Policy Network v likvidaci
- International Student Club of Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, o.s.
- iProtect z.s.
- Institut Digitalizace Stavebnictví Praha z.s.
- International Alter Systema Organization, z. s.
- Institut aplikovaného práva, z. s.
- IUVENTA, spolek umělecky nadaných dětí a mládeže, z.s.
- IN-LINE SKATING PROSTĚJOV o.s.
- Ink z. s.
- International Scientific Association Galilei, z.s.
- INITIUM NOVUM - NOVÝ ZAČÁTEK v likvidaci
- Ivančice - vize budoucnosti z. s.
- Internet mládeži z.s.
- Insolvenční poradna o.s.
- Italské krajanské sdružení Emilia Romagna v Praze v likvidaci
- I. Třebíčský Tenisový Klub
- Institut politických a ekonomických studií (IPES), z.s.
- ISTROPOLIS
- INF nord, z.s.