- International Society for Surface Science
- INKOM
- Institut pro ženy, z. s.
- iRonix o.s.
- IPMS Czech Republic,o.s. v likvidaci
- Isshinkan Hradec Králové, z.s.
- INVICTUS TEAM SPORT, z. s.
- Integrace CZ z.s. v likvidaci
- IBK KOMETA BRNO o.s.
- Institut pro podporu systemického řízení organizací
- IT BRNO o.s.
- IRMO, z.s.
- INTERPONS v likvidaci
- INSPIRACE, o.s.
- ITFE, z. s.
- Internet Test z. s.
- Institut pro podporu výchovně-vzdělávacích pracovníků (IVP), v likvidaci
- Italské krajanské sdružení Emilia Romagna v Praze v likvidaci
- IHC Dynamo Pardubice, z.s.
- INDIAN GIVERS, z. s.
- International Fiscal Association, Česká republika
- Institut pro behaviorální a ekonomická studia, z. s.
- Institut pro politiku a společnost, z.s.
- I. BIKE TEAM Benešov nad Ploučnicí
- Informační Centrum Cheprer
- Iluze klub Brno, o.s.
- Iniciativa za bezpečnost silničního provozu, z.s.
- INCENDIUM z.s.
- In-Line Hockey Club Chomutov
- Improve Yourself, z. s.
- IMPRESSIUM z.s.
- iZahrádka z. s.
- Institut dětí a mládeže České Budějovice, z.s.
- i4FUN, z.s.
- IKAAL, občanské sdružení
- Isarno, z. s.
- IAAS Česká republika, v likvidaci
- In Dust Troll, z.s. - v likvidaci
- ianus v likvidaci
- Institut pomoci při poškození mozku, z. s.
- INDOR - Klub uživatelů internetu v likvidaci
- Infocentrum Domain, o.s.
- International Society for Development of Information Technology, o.s.
- Iron Branch, z. s.
- Institut cestovního ruchu a vzdělávání, z. s.
- ICE TEAM České Budějovice z. s.
- IRSKÉ SESTRY, taneční skupina, zapsaný spolek
- IURS - Institut pro udržitelný rozvoj sídel z.s.
- INTER MIKULOVICE
- IHC Chemipro Chrudim z.s.