- Institut tradiční výroby pečiva, z.s.
- In Aqua Sanitas z.s.
- International Wolfdog Sport Club
- I love Olomouc
- Institut zdravotní prevence Bruntál z.s. "v likvidaci"
- Iniciativa pro evropské hodnoty z.s. v likvidaci
- ISA - International Skating Academy, z.s.
- iKnow Club
- ISIS-system
- I-net Centrum
- Iron City Live, z.s.
- Institut pro vysokou citlivost, z. s.
- IJP motocross team
- Inspire & Impact Network, z.s.
- IWATC z. s.
- Interpersonal factors
- ICT CZECH - KOOPERAČNÍ SDRUŽENÍ
- Institut autorských práv, z.s.
- Institut Virtuálního Soukromí, z.s.
- INTEGRATION v likvidaci
- Institut pro rozvoj sociální ekonomiky z.s.
- ICEO o. s.
- IMOTANA
- iniciativa Zachovejme rodinu, z.s.
- International Union for Agroforestry, z.s.
- IdeaHUB z.s.
- INNP X-Academy, z.s.
- INTBAU Czechia, z.s.
- Iglue
- INWAZE
- IP - SPORT
- Indianhead Club Pilsen z.s.
- INNA z.s. Havířov onkologická organizace
- Institut profesionálních manažerů, z.s.
- iProtect z.s.
- Institut pro restorativní justici, z.s.
- Infinitum z.s. "v likvidaci"
- imm studios, z.s.
- Inter Čechie Litvínov-garda 1968
- IHC KVASINY z.s.
- Institut sociální a kulturní antropologie medicíny
- IPMA Česká republika, z. s.
- ILLET - Institute for Language Learning, Education and Technology, z.s.
- IN-LINE CLUB QUECK Břeclav
- Institut pro politiku a společnost, z.s.
- inski České Budějovice, z.s.
- Institut profesní přípravy
- Inspiration company, o. s. v likvidaci
- Iron Warriors, z. s.
- Informační centrum Kavkaz - Východní Evropa z.s.