- I-net Centrum
- Institut pro dialog mezi civilizacemi, v likvidaci
- In nostrum posterus, z.s.
- Institut trvale udržitelného rozvoje z. s.
- Institut ochrany občanů, z.s.
- Institut medicínské právní ochrany zdravotníků
- I. Královský lukostřelecký klub z.s.
- IN LIFE, z.s.
- I. SK LEGES v likvidaci
- IN LINE KLUB Přerov
- Inovace pohybu a vzdělávání, z.s.
- Integrace a rovné příležitosti, z. s.
- I.V.V. z.s.
- Ičy & Skrečy z.s.
- iFolklor, z. s.
- I.V.M., z.s.
- IZS Team z. s.
- Institut mediální gramotnosti, z. s. v likvidaci
- Institut přeshraniční spolupráce, z.s.
- Italian Vision Club o.s.
- Inline Piráti Zlín, z.s.
- Indoor paintball Pardubice, z. s.
- Incoforum z.s.
- ICE FARM v likvidaci
- Irácké forum v ČR, z.s.
- ILCO Cheb, z.s.
- Institut aplikovaného práva, z. s.
- Institut pro evropskou politiku EUROPEUM, z.s.
- INSTITUT VZDĚLÁVÁNÍ OBČANŮ PRO ROZVOJ OBČANSKÝCH DOVEDNOSTÍ, MORÁLNÍCH VLASTNOSTÍ A VZDĚLÁNÍ, o. s.
- Integrace CZ z.s. v likvidaci
- International Youth Cooperation Czech Republic, z.s.
- Internet peering center o.s.
- International Police Federation z.s.
- Iniciativa pro evropské hodnoty z.s. v likvidaci
- Institut pro bioetiku
- Israeli Tactical And Combat System - Třebíč, z.s.
- Institut duchovního doprovázení, z. s.
- ILHK Hradec Králové z.s.
- IHC ROLLER STORM PRAHA, z.s.
- ILCO Novojičínska spolek stomiků
- Imobilus, z.s.
- ISP net consulting, o.s.
- Institut pro středoevropskou kulturu a politiku
- Iniciativa Nové odbory, z.s.
- IN-LINE CLUB QUECK Břeclav
- Iglauer Regionalkulturverband, o.s. - v likvidaci
- inBalance, z.s.
- Iniciativa STOP, občanské sdružení
- Institut vzdělávání Evy Kiedroňové, z. s.
- irontime z. s.