- Immanuel, z. s.
- International Federation of Palynological Societies
- International Union for Agroforestry, z.s.
- Institut pro integrativní přístup v psychoterapii
- ILGUAM z. s.
- Institut pro vzdělávání dospělých, z.s. - v likvidaci
- IN LIFE, z.s.
- Infinity Dance Team z.s.
- iNquinity o.s.
- Institut amatérského výtvarného umění o.s.
- Inovace pro budoucnost, z.s.
- INTER-TIR, Spolek podnikatelů v silniční dopravě
- irontime z. s.
- INTERLUDIUM v likvidaci
- Indian Community in Czech Republic z. s.
- ISHA Olomouc z.s.
- Institut českého venkova z.s.
- International Opportunities, o. s.
- Institut umělecké tvorby o.s.
- Internet pro všechny
- I. Karambol klub Chomutov
- IHC Nový Bydžov z. s.
- i-Kompas, z.s.
- Instituce profesionálních potápěčských instruktorů v likvidaci
- Institut PONTES, v likvidaci
- IRONMAN SUDOMĚŘ TEAM v likvidaci
- Independent Order of Odd Fellows - Sesterská Lože No. 1 Ludmila v likvidaci
- Inzulínek, z. s.
- IHC LOMNICE, z. s.
- IV. odboj z.s.
- Institut zdravá rodina z.s.
- Informační média Česká Republika, z. s. v likvidaci
- INDOnesianGate kulturní a vzdělávací centrum, z.s. zkrácená froma: INDOnesianGate
- INSTITUT BEZPEČNOSTI PRÁCE, POŽÁRNÍ OCHRANY A ŽIVOTNÍHO PROSTŘEDÍ
- Institut pro podporu finanční gramotnosti, o.s.
- IHC ROLLER STORM PRAHA, z.s.
- INEX - Sdružení dobrovolných aktivit, z. s.
- Institut komparativních politických studií v likvidaci
- Integrace a rovné příležitosti, z. s.
- Italský vzdělávací institut z.s.
- infinity - progress z.s.
- INFO KULTUR
- IODA, z.s.
- Indicus Bohemie z.s.
- Institut pro vědecký výzkum vývoje ve východní Evropě v likvidaci
- IHC Chemipro Chrudim z.s.
- Institut pro studium ekonomiky a politiky, z.s.
- I. Sbor vojenských záložníků Československé republiky v likvidaci
- Institut pro Digitální forenzní analýzu, z.s.
- Institut digitálního vzdělávání a transformace, z.s.