- Isar z. s.
- Iktočante Holešov, z. s.
- IŠTAR
- inteRaction e-sports club v likvidaci
- Inter Club Cechia Nerazzurra z.s.
- Institut kvality sociálních služeb, z.s.
- IRSKÉ SESTRY, taneční skupina, zapsaný spolek
- ISTROPOLIS
- Inkasní institut České republiky, o.s.
- Iwama Aikido z.s.
- INVESTIČNÍ KLUB MORAVIA v likvidaci
- Iniciativa pro efektivní zdravotnictví, z.s.
- International Association for Managers Potential, z.s.
- iVltava.cz
- International Health Coaching Association (IHCA), z.s.
- Imobilus, z.s.
- International Gold Event 2017, z. s.
- Inspirelie, z. s.
- International Student Union of Charles University in Prague - Faculty of Medicine in Hradec Králové v likvidaci
- Institut pro rozvoj měst a obcí z.s.
- International Krav Maga Federation
- IFMSA Česká republika, z.s.
- IN DUBIO PRO REO, o.s.
- Indonesian Dream Farms z.s. v likvidaci
- Informační média Česká Republika, z. s. v likvidaci
- INDIAN MOTO VETERÁN KLUB JIŽNÍ ČECHY - INDIAN MOTOCYKLE SOUTH BOHEMIA CLUB, z.s.
- Interaktivně dětem, z.s.
- ITL, občanské sdružení v likvidaci
- Institut prevence, z. s.
- ISIDA AMENTI
- Ivanovice proti R43
- IVT Náchod - cyklistický klub, o.s. v likvidaci
- International Society of Adenomyosis and Intrauterine Surgery z.s.
- InEurope z.s.
- Institut pro křesťanskou kulturu, spolek
- Integrace a rovné příležitosti, z. s.
- Improve sport z.s.
- Institut sportovního vzdělávání, z.s.
- INFOSPEKTRUM o.s.
- INTROPE z.s.
- Institut poradenské psychologie z.s.
- INCITAT-občanské sdružení chovatelů, jezdců, milovníků koní a sympatizujících
- IADO PARDUBICE
- Institut ochrany občanů, z.s.
- Institut rozvoje slovensko-české spolupráce
- Institut pro péči o kulturní a intelektuální dědictví, z.s.
- IBFF Fit Kids Czech Republic, z.s.
- Institut vzdělání a výzkumu v AAS, z. s.
- Iluze klub Brno, o.s.
- Iniciativa pro svobodnou Sýrii