- INCUREGO
- Institut kresby a grafiky, z. s.
- Iniciativa OPEN DOORS, z.s.
- Institut pro regulaci hazardních her z.s.
- International Development and Equality Alliance z.s.
- IMRG Pardubice z.s.
- International Police Association - sekce Česká republika z.s.
- iChange, z.s.
- Innebandy klub Brno
- Iniciativa Park
- Institut médií a práva, z.s.
- Institut pro evropské záležitosti, o. s.
- I. SK LEGES v likvidaci
- Institut rozvoje Krajské hospodářské komory StČ, z.s.
- Iniciativa Nové odbory, z.s.
- Informační centrum veřejného sektoru v likvidaci
- International Krav Maga Federation
- Investiční klub Veverka z. s.
- Infanterie Regiment No.74 v likvidaci
- ISIDA AMENTI
- Iniciativa za bezpečnost silničního provozu, z.s.
- INESAN, o.s.
- Infoscience, z.s.
- INDOnesianGate kulturní a vzdělávací centrum, z.s. zkrácená froma: INDOnesianGate
- Iglesia Ni Cristo (Church of Christ), z. s.
- ILEA
- IPMA Česká republika, z. s.
- International Students Medical Association in Pilsen - ISMAP o.s.
- Internet Nový Rychnov, z. s.
- International Machine Design Association, z. s.
- Institut rozvoje společenské odpovědnosti, z.s.
- In The Country Aš
- In-Move z.s.
- ITchallenge
- I. Sportovní střelecký klub Sázava
- Ignis Iter, z. s.
- Institut sociálních hnutí
- Institut pro podporu finanční gramotnosti, o.s.
- Inter nos
- International Ensemble, z.s.
- IFAS Pardubice, z. s.
- INTEGRIS z.s., v likvidaci
- Institut Váši Příhody, spolek
- Institut živé filosofie z. s.
- Institut dětí a mládeže Praha 3, z. s.
- Inline škola Heartbeat z.s.
- IBIS CLUB z.s.
- Institut kariéry a rozvoje, z. s. v likvidaci
- Iniciativa 3DAC z.s.
- IRON-STONE FREERIDE