- Indepedent Order of Odd Fellows - I.O.O.F., Česká republika
- ICE SPEEDWAY CLUB Přelouč
- Integrační sportovní klub IFC z. s.
- Institut sociálních hnutí
- Institut komunikačního vzdělávání z.s.
- Institut vzdělávání a volného času České republiky, o.s.
- Institut pro vzdělávání a asimilaci, z.s.
- INICIATIVA BULHAR, z.s.
- Interfona-Praha v likvidaci
- IRON BIKERS v likvidaci
- iPACIENT z.s.
- INSTITUT KOMUNIKAČNÍCH TECHNOLOGIÍ, z.s.
- Informační fórum Evropa bez bloků v likvidaci
- Inside Games z.s.
- Inner Peace z.s.
- Informační centrum
- Institut digitálního vzdělávání a transformace, z.s.
- I.T.C Club
- INTEGRIS z.s., v likvidaci
- IPUP, z. s.
- i117 z. s.
- Institut pro investice a inovace (Institute for investment and innovation) z. s.
- Institut středoevropských studií
- Illuminati
- Inomaker, z.s.
- In Spin, z.s.
- Institut pro vysokou citlivost, z. s.
- Institut poradenské psychologie a vzdělávání z. s.
- Institut Didaktik, o.s.
- Institut mediální tvorby, z. s.
- Internetový institut z. s.
- Institut parlamentních analýz o.s.
- INTERCANIS z. s.
- Interaktiv, občanské sdružení při PrimMat-Soukromé střední škole podnikatelské, z.s.
- Isabella Romano
- Industrial Ostrava, z.s. "v likvidaci"
- Iniciativa STOP, občanské sdružení
- Institut Virtuálního Soukromí, z.s.
- Institut stavební a ochrany přírody, z.s.
- Institut kariéry a rozvoje, z. s. v likvidaci
- INSPORT
- IT Insurance Alliance
- IT Klub z.s.
- IYF - Mezinárodní asociace mládeže, o.s. v likvidaci
- Integric Management Institute v likvidaci
- Indoor Klub Žlutice o.s.
- INDOOR´S, z.s.
- INICIATIVA, občanské sdružení Valšov
- ISSIMA
- Inženýrské a projektové služby pro stavebnictví Čes.Budějovice