- International Presbyterian Church in Europe, z.s.
- Italian-Czech Jurist Association z.s.
- Institut digitálního vysílání, z.s.
- ILCO Tábor, z.s.
- Institut sociálních hnutí
- Internet Nový Rychnov, z. s.
- Institut pro péči o kulturní a intelektuální dědictví, z.s.
- International Christian Fellowship Praha z.s.
- Institut kariéry a rozvoje, z. s. v likvidaci
- International Machine Design Association, z. s.
- Indian Community in Czech Republic z. s.
- Institut pro média a data, o.s.
- IMA dance z.s.
- IGS Agency, z.s.
- Implantologický klub ČR
- IGOR - Nové hnízdo, z.s.
- Institut technického a ekonomického znalectví, z. s.
- IN TIME
- ikha studio z. s.
- IQ Roma servis, z.s.
- Iniciativa za levnou MHD, z. s.
- Israeli Tactical And Combat System - Třebíč, z.s.
- Inspiro-agentura z.s.
- I Love o.s.
- IT Klub z.s.
- IMAPS - mezinárodní společnost pro mikroelektroniku a pouzdření IMAPS, z.s.
- IQ školka Delfínek, z.s.
- IPPON KARATE KLUB SHOTOKAN BEROUN, z.s.
- I. šipkový klub OTROČÍN
- IN-LINE VESELÍ, z.s.
- Information Technology Service Management Forum - Česká republika v likvidaci
- II Dolcimelo
- Investiční klub Veverka z. s.
- ICES z.s.
- Institut politického marketingu, z.s.
- Inomaker, z.s.
- Inspirokracie, z. s.
- Institut ontologických věd a implementací
- iLikeSharePoint
- Ibérica, z.s.
- IM Rezona z. s.
- Impresio Art
- I. CHODSKÝ TRIATLONOVÝ KLUB
- INSPIRACE, o.s.
- IDC - BOARD z.s.
- INTERNATIONAL CYNOLOGICAL ASSOCIATION o.s. v likvidaci
- Inter nos
- Inline škola Heartbeat z.s.
- IHC Nový Bydžov z. s.
- iShorts, z.s.