- Ivanovice na Hané - město pro všechny, o.s.
- Indigo Děčín, z.s.
- International Student Union of Charles University in Prague - Faculty of Medicine in Hradec Králové v likvidaci
- INNOVASION, z. s.
- Ivanka dětem , z.s.
- ic-net v likvidaci
- Independent Order of Odd Fellows-Dorothea lóže č.5, z.s.
- Indianhead Club Pilsen z.s.
- IUS INFINITUM z.s.
- Impulsia Sport Kolín v likvidaci
- IRIL
- Iniciativa Benice 2019 z.s.
- Institut bioetických studií
- Infoscience, z.s.
- IKAP4OK z.s. v likvidaci
- Indonesian Dream Farms z.s. v likvidaci
- IHC Unhošť
- Interaktivně dětem, z.s.
- ISZ, z.s.
- ICE TEAM České Budějovice z. s.
- Institut Authentica, z.s.
- Institut pohostinného přátelství z.s.
- Informační a publikační centrum ALARM
- Indicus Bohemie z.s.
- INFUN be FUN z.s.
- Instrumental, z. s.
- In-line klub, z. s.
- INDOR - Klub uživatelů internetu v likvidaci
- IPSC Skála Stěbořice, z. s.
- INNA z.s. Havířov onkologická organizace
- Institut klasické kytary
- ISP net consulting, o.s.
- Imjoy z.s.
- ILCO Tábor, z.s.
- I. český racketlonový klub, z.s.
- Intertalent, z.s.
- Infanterie Regiment No.74 v likvidaci
- ICYB - International Centre for Young Beekeepers, z.s.
- Imagine United Dreams, z.s.
- INTERCANIS z. s.
- International Health Coaching Association (IHCA), z.s.
- International Science and Engineering Society, z.s.
- iHLINSKO.cz, z.s.
- Incoforum z.s.
- In-line G o. s.
- Institut rodin
- Inovace v dopravě, o.s.
- Independent Order of Odd Fellows - Sesterská Lože No. 1 Ludmila v likvidaci
- ISIS
- INTERNATIONAL TENNIS CLUB Prague, z.s., v likvidaci