- Institut vzdělávání Evy Kiedroňové, z. s.
- International Scientific Association Galilei, z.s.
- INCITAT-občanské sdružení chovatelů, jezdců, milovníků koní a sympatizujících
- Institut pro restorativní justici, z.s.
- itSMF Czech Republic, z.s.
- ITFE, z. s.
- INEZAR, z.s.
- In-line G o. s.
- In Nomine Bohemia z.s.
- Integric Management Institute v likvidaci
- Internacionální Federace Bobbingu "v likvidaci"
- IN-LINE CZECH COMMUNITY o.s.
- INWAZE
- Indepedent Order of Odd Fellows - I.O.O.F., Česká republika
- International Consulting&Research Association z.s.
- Institut mezinárodního vzdělávání, z. s.
- Institut pro regulaci hazardních her z.s.
- Institut pro bibliodrama a práci s biblí
- InGarden z.s.
- iKnow Club
- I. USP Slamník Vršovice 1972 v likvidaci
- Italsko-moravská kulturní a historická asociace
- IT BRNO o.s.
- Institut terapie zaměřené na emoce, z. s.
- Institut právních studií z.s.
- ISACZECH, z.s.
- iDobříšsko.cz, z. s.
- IPPON KARATE KLUB SHOTOKAN z.s.
- INSPIRACE Slavonice, z. s.
- IN DUBIO PRO REO, o.s.
- IBK KOMETA BRNO o.s.
- Institut bezpečné dopravy, z.s.
- Institut technického a ekonomického znalectví, z. s.
- iPraha8.cz z. s.
- Infocentrum Domain, o.s.
- IHC KVASINY z.s.
- Integrační centrum BALTAZAR, z.s.
- International Kennel Club, z.s.
- INTEGRATION v likvidaci
- INTERCANIS z. s.
- IDEM PER IDEM (I.P.I.), v likvidaci
- IKAAL, občanské sdružení
- Iglesia Ni Cristo (Church of Christ), z. s.
- INTER MIKULOVICE
- Institut veřejného prostoru, z.s.
- Institut profesního vzdělávání z. s.
- imm studios, z.s.
- ICE SPEEDWAY CLUB Přelouč
- Independent Order of Odd Fellows-Dorothea lóže č.5, z.s.
- Infinity Dance Team z.s.