- iNquinity o.s.
- Integrační centrum BALTAZAR, z.s.
- Institut přírodní medicíny
- Inlajn.Cz, z.s.
- Indonéská společnost v Československu, v likvidaci
- Irácké forum v ČR, z.s.
- INVAHELP z.s.
- Iniciativa pro zdravé zdravotnictví, z. s., v likvidaci
- INSTITUT PRO AKTIVNÍ DOMY, o.s.
- IPC Motion, z.s. v likvidaci
- Ingejáni, v likvidaci
- Institut pro dialog mezi civilizacemi, v likvidaci
- IHC DEVILS ZLÍN, z.s.
- Institut mezioborových studií, spolek v likvidaci
- INDIRACING z.s.
- Institut manažerského výzkumu z.s.
- Institut vzdělávání a volného času České republiky, o.s.
- IndiPro - Škola fotbalových dovedností, z. s.
- Inovace v dopravě, o.s.
- International Society for Stereology & Image Analysis, z. s.
- International Krav Maga Federation
- IPPON KARATE KLUB SHOTOKAN z.s.
- IMPULS z.s.
- ISEA - Institut pro sociální a ekonomické analýzy, z.s.
- Institut bezpečnosti strategické infrastruktury z.s.
- Identity Prague, z. s.
- Institut manažerské ekonomie z.s.
- Idea Boom, o.s.
- Institut systemického koučování v likvidaci
- Institut pomoci rodičům samoživitelům, z. s.
- IT Klub z.s.
- In Nomine Bohemia z.s.
- IMORTELA z. s.
- i-com-unity z. s.
- Islám v České republice nechceme
- In Rem Natura, z.s.
- Institut PONTES, v likvidaci
- Into Movement, z.s.
- Institut pro podporu finanční gramotnosti, o.s.
- inkonTY, z.s.
- IBK GL 98 v likvidaci
- Institut politických a ekonomických studií (IPES), z.s.
- INSTITUT EVROPSKÉHO VZDĚLÁVÁNÍ, o.s.
- INDOnesianGate kulturní a vzdělávací centrum, z.s. zkrácená froma: INDOnesianGate
- Interaktivně dětem, z.s.
- Informační centrum
- Iura novit curia
- Informační centrum Kavkaz - Východní Evropa z.s.
- ILGUAM z. s.
- In Cordis z.s.