- Intuiti Group z.s.
- IT Klub z.s.
- INTEGRA HELP CENTER z.s.
- Italian Vision Club o.s.
- Indigo o.s.
- Indicus Bohemie z.s.
- Indiánské léto z.s.
- Iglauer Regionalkulturverband, o.s. - v likvidaci
- IN TIME
- ITL, občanské sdružení v likvidaci
- ISP net global, o.s.
- IBK GL 98 v likvidaci
- Institut Williama Wilberforce, z. s.
- IBK Kubánský Klan, z.s.
- Isysport Praha v likvidaci
- Imjoy z.s.
- Iniciativa Romů Restart , z.s.
- Interfona-Praha v likvidaci
- Integrace s charitou, občanské sdružení
- INOX Tri Team
- Institut mezioborových studií, spolek v likvidaci
- iniciativa Zachovejme rodinu, z.s.
- Isara, z.s.
- Institut pro evropské záležitosti, o. s.
- In-line G o. s.
- IPF Group z.s.
- Indoor paintball Pardubice, z. s.
- Iniciativa Tuchoměřice, o.s., v likvidaci
- INKA o.s., v likvidaci
- Iuvamus, z. s.
- Iron Cavalry LE MC, z.s.
- INVEST IN BRAVERY, z.s.
- International Krav Maga Federation
- International Scientific Institute, z.s.
- International Society for Stereology & Image Analysis, z. s.
- International Consortium for Cell Therapy and Immunotherapy, z.s., v likvidaci
- Investiční klub Veverka z. s.
- IBK Sodra Bohmen, z. s.
- INNA z.s. Havířov onkologická organizace
- ISTROPOLIS
- IHC Olomouc Eagles, z.s.
- Institut znalostního rozvoje, z.s.
- Infoport v likvidaci
- Irish Dance z.s.
- Indiánky, z.s.
- Iuridicum Remedium, z. s.
- Institut pro výzkum místních a regionálních dějin, z. s.
- Information Society for Equal Chance, v likvidaci
- INFOCENTRUM Dobřichovice, z. s.
- In-Line hokejový klub Outsiders Pardubice o.s.