- EUROPEAN SAMBO UNION, v likvidaci
- eBRÁNA
- Efiduolos, o.s.
- Evropská iniciativa o. s.
- Elis koně z.s.
- ERAWAN GYM
- EAGLES Praha z.s.
- European Ski School of Amputees. z. s.
- ETIKA PODNIKÁNÍ A VEŘEJNÉ SPRÁVY v likvidaci
- Eventing Team z.s.
- Extreme Dogs, z.s.
- Energeticko - vodárenský inovační klastr z.s.
- Equisport Turzík Perná, z. s.
- Edu Silesia, z. s. "v likvidaci"
- Ecolodge Nepál z.s.
- Easy kvízy, z.s.
- ELECTRA-CITY, o.s.
- Ed6u elemic racing
- ERIK (Evropský Romský Informační Klub)
- EFATA z.s.
- Ecopulse CZ, z.s.
- EQUS GLACENSIS v likvidaci
- Ekosrdcař z.s.
- Evropská asociace rozvoje sportu z. s.
- Evropská asociace fotografů, o.s.
- EUnity z. s.
- EMSOC z.s., v likvidaci
- EAGLES, z.s.
- Enerkom Tišnovsko, z.s.
- Elipsa v likvidaci
- European Network for Financial Education, z. s. v likvidaci
- ELITA VK
- eco prag z.s.
- ENERKOM Buchlov, z. s.
- EKOCENTRUM U nás z. s.
- Extreme trail park Vinaře, z.s.
- ELIM Pardubice, křesťanská společnost pro diakonii, z. s.
- ESSENTIAL CLUB
- ELASA CZ
- Estrella z.s.
- EASTERN - občanské sdružení pro podporu a rozvoj výtvarného a kulturního života v České Lípě
- EP Kids, z.s.
- Evropská asociace židovských dětí přeživších Holocaust
- Expedition Club International z.s.
- E.H.T.
- ENDURO LITOMĚŘICKO, z.s.
- Edoras Estel - společenství přátel a bližních Estelinoru v likvidaci
- EKO POINT v likvidaci
- ENERKOM Česko z. s.
- EKONAUT o.s.