- Element pohybu, z.s.
- EKOENERGOREGION
- ELBERETH ROCK
- Evropská diplomatická komora
- Ebed, z.s.
- EOL energy z.s.
- ERMITÁŽ MATAL
- Energie pro všechny
- Equi-Help Dobříš z.s.
- Ekologické hnutí Gréta, z.s.
- EVA - European Virtual Association
- Ecological Solutions, z.s.
- Ekocamp Jeseníky, z. s.
- ENDURO ŠKOLA PROMOTO
- European Science and Art Publishing, z.s.
- Euphorica, z.s.
- EUSIS - EUROPE START - UP - IMMIGRANT, o.s.
- EDUINO - Asociace pro edukaci a inovace ve vzdělávání, z.s.
- Exit, o. s.
- Elektrotechnický cech České Budějovice
- EDU CAS LOVE, z. s.
- Evropský investiční a rozvojový institut, z.s.
- Ekologické Jinonice v likvidaci
- Event media sport z. s.
- eDELTA, z.s.
- EPS aktivity, z.s.
- Elektrotechnický cech Tachov z.s.
- ECO BAU z.s.
- EKOFORUM 2001
- EDUCATIO, z.s.
- EKOmysl, z. s. "v likvidaci"
- Evropský institut pro bezpečnost a životní prostředí, z.s.
- EarthLab z.s.
- Esthete author z.s.
- ELSA Plzeň, z.s.
- EXTREME GOLF CLUB KOŠOV v likvidaci
- EUROFOAM SPORT TEAM
- Escaper.cz, z.s.
- EquiTeam, CZ v likvidaci
- Emauzský spolek Gregorius
- EU SOCIETAS EUROPAEA - unie z. s.
- EFPC, z.s.
- Endorphin Republic z.s.
- Education for living z.s.
- Energický spolek
- Euroregion Šumava - jihozápadní Čechy, z. s.
- EUROIN občanské sdružení
- Elim Písek, z. s.
- EKOLOV, v likvidaci
- Evropský dopravně - vzdělávací institut, z.s.