- Ekosociální centrum Znojmo, o.s.
- Estrela verde
- Ekoklub Pampeliška, z.s.
- Expedice I.K.S., z.s.
- Evarcha - v likvidaci
- European Civil Liberties Union, z.s.
- Enduro cross Plzeň, z.s.
- EOL energy z.s.
- Expediční a střelecký klub, z.s.
- ENERKOM Písecko z.s.
- EKONA v likvidaci
- EURYTMIE, z. s.
- Expedice Bohemia v likvidaci
- EUROPA AURORIAN SPOLEK PRO KULTURU A VZDĚLÁNÍ
- EDUakademie, z.s.
- Ekocentrum Fryčkovna
- ENVIKO, z.s.
- Enerkom Tišnovsko, z.s.
- Ellinka
- Ex cinere 1119, z.s.
- Edíčkovci, z.s. v likvidaci
- Evropský Institut Profesního Vzdělávání v likvidaci
- Early Education o.s.
- Edukana, spolek
- Evropa v regionu z.s.
- ELSA Brno, z.s.
- Edmundova soutězka
- Energie pro každého
- Ecce Homo Šternberk, z.s.
- Evropská demokratická mládež v České republice v likvidaci
- ERIK (Evropský Romský Informační Klub)
- Enduro klub Palkovice,z.s.
- East Tennis Club spolek
- Evropská komora nucených, exekučních a konkurzních správců a likvidátorů, o.s.
- EduLaw, z.s.
- Efektivní veřejná doprava pro Havířov a okolí, z. s.
- EKOLOGICKÁ UNIE 734
- ENVI & CULTURE INSTITUTE z.s.
- ESET
- Ekologické centrum Žatec, spolek v likvidaci
- Ekolidé
- EuroCenter 4 mobility, z.s.
- Erasmus Gathering, z.s.
- Evropské společenství Slovanů sv.Cyrila a Metoděje v likvidaci
- Energie pro všechny
- Educa Socio House z.s.
- Ekoagro-Krajina o.s.
- ENERVIT Team v likvidaci
- EUROTALENT
- European Tiny House Association, z.s.