- Erthad, z.s.
- Evropská komora architektů, z.s.
- EQUS GLACENSIS v likvidaci
- Enviopress o.s.
- EDUCATIO, z.s.
- Entre Sociale z.s.
- European Photo Association, z.s.
- Extreme sports association o.s.
- Educent z.s.
- Erasmus Student Network Liberec z. s.
- ERIK (Evropský Romský Informační Klub)
- Elektrica Musica z. s.
- ELSA Brno, z.s.
- Euroregionální svaz chovatelů
- Etiopská komunita v ČR - spolek
- EDUCIN, z.s.
- EquiStable Korycany, z.s.
- Enviromentalistický zelený kříž, z.s.
- ESCoART-Evropské sdružení pro současné umění v likvidaci
- European Institute for Molecular Hydrogen Therapy, z.s.
- EXERGIE v likvidaci
- EVEREST, spolek Vrbno
- Emmaus Praha v likvidaci
- ECOPOLIT, o.s.
- Exedra
- eFeF companion
- European Cyber Security Excellence Center, z. s.
- Escala, z. s. v likvidaci
- EURYBIA YACHT CLUB z.s.
- Emerik Blum, z.s.
- El Fumador, z.s.
- EUROJUKEBOX, z.s.
- EX ANIMO o.s.
- EquiAthlete, z.s.
- Equittana - azyl z. s.
- ENERKOM Bobrava, z.s.
- EDUGEN z. s.
- EDUCANOVA, z.s.
- EKO Průhonice v likvidaci
- Ekologické hnutí STROM, z.s. v likvidaci
- Ecolodge Nepál z.s.
- EDUCOM/SPORT z.s.
- Effective thesis z.s.
- Eduking, z.s. v likvidaci
- Experiment 23, z.s.
- East European Information Centre, z.s.
- Evropský kongres literátů, občanské sdružení
- Evropské fórum pro efektivní využití energie v likvidaci
- Ensemble Damian z.s.
- E-sdílej, z. s.