- ENT talk z. s.
- E-MOC-E, z.s.
- EMIJA orient, z.s.
- Exotický Ráj Foundation z.s.
- Edíčkovci, z.s. v likvidaci
- Ekologické Křenice u Prahy z.s. v likvidaci
- Enduro-Motocross team Orlová z.s.
- ETORDA O.S.
- Exadversus z. s.
- EkoPULA
- eXTReme Jaroměř, o.s. v likvidaci
- Ekostudio, o.s.
- Energetické společenství Sousedství Kukleny, z.s.
- Ejpovice k životu z.s.
- Excalibur Brno, z.s.
- ERTISCHOWITZ
- Euroregion Pomoraví, spolek
- Elite Lhenice, z.s.
- EASTERN - občanské sdružení pro podporu a rozvoj výtvarného a kulturního života v České Lípě
- ES Česko z. s.
- Extreme Wheels Rožnov, z.s.
- EU Relaunch, o.s.
- Energie jinak z.s.
- Ekologické sdružení polabské louky Sadská v likvidaci
- Epona Jičín v likvidaci
- e-Finance Equestrian Club, z.s.
- Ekologická společnost Vlast
- ExARGEMA, z. s.
- European Ice School z.s. v likvidaci
- ESET
- Ekocentrum Příbram z.s.
- Ensemble Inégal z. s.
- Evropský dům Mariánské Lázně
- Elektrotechnický svaz český, z. s.
- Evropská iniciativa o. s.
- Eventer, z.s.
- ELSA Olomouc, z. s.
- ESTAVELA SPORT CLUB o.s.
- ELEA o.s. v likvidaci
- Energetická komunita Stolové hory, z. s.
- Eminere, z. s.
- Ekologické sdružení Lískový dvůr
- ERC (Evropské regionální centrum) z.s.
- Evropský památkový ústav, z.s.
- Error, o. s.
- Edoras Estel - společenství přátel a bližních Estelinoru v likvidaci
- Evropská federace aplikovaných pohybových aktivit, z.s.
- Euroškolák, z.s.
- Ekologické sdružení občanů obce Nové Dvory v likvidaci
- Edu-Act z.s.