- Euro federation hockey and football
- Easy target
- ENDURO TEAM SLOVÁCKO z.s.
- Evoluce - Jihočeské centrum českého znakového jazyka z.s.
- Extrasystem Praha, spolek
- Eduka Bábetko z.s.
- EH Motorsport z.s.
- EUROPEAN POLE DANCE FEDERATION, z.s.
- evolve club z.s.
- Energický spolek
- ELCY - Elektrocyklisté, z. s.
- ELBERETH ROCK
- Eskimák sports
- EXTREM5HILLS z.s.
- Educalink o.s.
- Eagles Brno, z.s.
- Elektrotechnický cech České Budějovice
- EUROPEANA HANDICAP, z.s.
- Elpis, z.s.
- Eastside Fighters Gym z.s.
- Ekologické sdružení občanů Ovčár-průmyslová zóna
- Ekofarma Jalový dvůr, z.s.
- EFA - fotbal z.s.
- EKOLOGIE PRO ŽIVOT o.s.
- EURO-PROJECT "v likvidaci"
- European DanceSport Union
- Etriatlon Team, z.s.
- EURO-WALLACHIA
- ESTinstitute, z.s.
- European Models Association, z.s.
- EDINE - EUROPE o.s.
- ERKO Esports z. s.
- Ekologica z. s.
- Estrádní soubor VEŠke, z.s.
- EDU-ART PRAHA
- Edova stopa, z.s.
- Ekologická multimedia v likvidaci
- Evropská mezinárodní tisková agentura, z.s.
- Evropský institut pro rozvoj lidských zdrojů
- ELEKTRON, vzdělávací centrum
- eXTReme Jaroměř, o.s. v likvidaci
- Ein Gedi, z. s.
- Ecological Solutions, z.s.
- eBRÁNA
- Ekosociální centrum Znojmo, o.s.
- Ekocentrum Poustka z. s.
- EGTA CZ v likvidaci
- Expediční a střelecký klub, z.s.
- Ekospolek Vysočina z.s.
- Erasmus Student Network VŠB-TUO, z. s.