- Ecclesia podcast, z. s.
- Edulink
- EXTREME GOLF CLUB KOŠOV v likvidaci
- Ekocentrum DUHA z.s.
- Equiteam Mersi, z. s.
- Elišáček z.s.
- ELSA Česká republika, z.s.
- EKOMA poradenské centrum z.s. "v likvidaci"
- EXTREME TRIAL CLUB
- Evropský řád rytířů vína, spolek
- Exclusive Fitness Šibeniční vrch
- Ekipa, z.s.
- Evento z. s.
- eXTReme Jaroměř, o.s. v likvidaci
- Extreme Snow Crew v likvidaci
- Evropský investiční a rozvojový institut, z.s.
- Eventum Education z. s.
- Erudito, z. s.
- Ein Gedi, z. s.
- Endurance Stable Semiramis "z.s."
- ENVIRA v likvidaci
- Eiendom z.s.
- E´VIA, občanské sdružení = evropská cesta ke vzdělávání, informovanosti a aktivizaci
- Ekonomická studentská organizace
- European Models Association, z.s.
- EquiTeam Bohemia, z.s.
- Ekologická společnost Lhota, v likvidaci
- ENERKOM Moštěnka, z.s.
- E-Bridge, z.s.
- ENVIA "v likvidaci"
- EKOVESNICE z.s.
- EKO Kuří v likvidaci
- ES-KA veterán klub
- EKOLOGICKÁ UNIE 734
- Euphorica, z.s.
- Elektro Hat o.s.
- Evropský dům Jihlava z.s.
- Equiklub Slavošov
- EQUIJUMP Líšnice z.s.
- ELEA o.s. v likvidaci
- ESN UCT Prague, z.s.
- EQUICENTRUM - Jaroměř z.s.
- Evropské fórum pro efektivní využití energie v likvidaci
- EKO DRIVE v likvidaci
- Eurynomé z Chaosu z.s.
- English camp Pastviny, z.s.
- Excellence Network
- EREBUNI z.s.
- Empatie
- Elektrotechnický cech Písecka