- Expertní komora kariérového poradenství, z.s.
- EFEKT, o.s.
- ENERKOM Krnovsko z. s.
- EDUmix, z.s.
- EHK karate club z.s.
- Enduroškola z.s.
- Ekologické sdružení občanů obce Nové Dvory v likvidaci
- EkoPULA
- EXTREME GOLF CLUB KOŠOV v likvidaci
- ECO BAU z.s.
- EDYN Czechia z.s.
- Ecopulse CZ, z.s.
- Equittana - azyl z. s.
- EuroCenter 4 mobility, z.s.
- European Association of Cloud Service Providers z.s.
- Experiment Ostrov, z. s.
- Evropa doma z.s.
- EUROTEAM CZECH REPUBLIC, z.s.
- Evropská platforma, z. s.
- EUROPEANCLUB
- Europa UOMO CZ, z.s. - v likvidaci
- European Great Commission Collaboration, z.s.
- ELEVEN-RUBENA TEST TEAM
- Eminere, z. s.
- Energy 49 v likvidaci
- EKO OBORA HVĚZDA v likvidaci
- Ekologický spolek občanů obce Braškov
- Epoque Quartet , z. s.
- ELDORÁDO, spolek dětí a mládeže
- ENERKOM CR spolek
- ESET - HELP, z. s.
- EU MOVE z.s.
- EU Trade Association, o.s. v likvidaci
- Elánek KIDS z.s.
- ELBA Ústí nad Labem o.s. v likvidaci
- Educato, občanské sdružení
- EKOKLUB Zlín v likvidaci
- ELDEN Brušperk, z.s.
- Ehlers - Danlosův syndrom a syndrom hypermobility, z. s.
- European Center for Civic Initiatives, z. s.
- Enjoy Kurdějov z.s.
- Exkurzní a turistický oddíl při Veterinární univerzitě Brno, z. s.
- EUROPEAN MEDIA ASSOCIATION,o.s.
- ELLIPTICO The CLUB z.s.
- EduCare
- Eastern Alliance
- Ekologické sdružení Lískový dvůr
- E´VIA, občanské sdružení = evropská cesta ke vzdělávání, informovanosti a aktivizaci
- Eskadra o.s.
- EducationTalentCulture, z.s.