- EY Free Life, z.s.
- ESO 98
- Evropský klub
- EUROTALENT
- EduCorn, z. s.
- Elitní spolek přátel MJ
- EUNOMIE
- EFA - fotbal z.s.
- Evangelikální společenství křesťanů, z.s.
- Ekoklub Pampeliška, z.s.
- Elitní projekty ČZU, z.s, v likvidaci
- EKOVLK o.s.
- EXLIBRIS, spolek přátel umění
- EREMY, z.s., v likvidaci
- EDI, z.s.
- EQUITY CZECH "v likvidaci"
- EKOMA poradenské centrum z.s. "v likvidaci"
- Eufour, o.s.
- ESTAMOS BEM, z.s.
- Expedice žití z.s.
- EDUGEN z. s.
- Ellel - služba vnitřního uzdravení, Česká republika, z.s.
- ETNA - ŠKOLSTVÍ
- El Fumador, z.s.
- Evropské společenství Slovanů sv.Cyrila a Metoděje v likvidaci
- Evropská unie umění z. s.
- ELF dětem z.s.
- EURO BIKE PRAHA v likvidaci
- Events 4 you, z.s.
- Energie pro každého
- Ekologické sdružení občanů obce Ronov nad Sázavou v likvidaci
- EUROBURZA
- Educate z. s. v likvidaci
- Easyfree "v likvidaci"
- EMBAYA o.s.
- Emilův klub gurmánů a příznivců piva, z.s.
- Ein Gedi, z. s.
- European Hockey Clubs Union z. s.
- ELDORÁDO, spolek dětí a mládeže
- Education for Employment, z.s.
- Erasmus Student Network Česká republika z. s.
- Edata-base,o.s.
- Element Karlovka z. s.
- ExperiPent, z. s.
- EURO CLUB MASTRONARDI
- Ekologický výbor Veltrusy v likvidaci
- EH racing, z.s.
- E.W.A. agency v likvidaci
- Ekologická a humanitární služba občanů Na Farkáně, z.s.
- Eager Swingers o.s.