- Energy Healing Therapy z.s.
- ELSA Česká republika, z.s.
- EUSIS - EUROPE START - UP - IMMIGRANT, o.s.
- Egalita, z.s.
- E16100 z.s.
- ExARGEMA, z. s.
- ERBIA Golf Club z.s.
- ENHA Ostrava - Sportovní klub pro parkour a trampoliny z. s.
- EUROASIA v likvidaci
- Euroidea o.s., v likvidaci
- Edelweiss CZ PRAHA, z.s.
- Edgar Allan Poe Society of Prague v likvidaci
- ENERKOM Podlipansko, z.s.
- Eduka Bábetko z.s.
- Eppas z.s.
- Evropské komunikační centrum v likvidaci
- Expedice I.K.S., z.s.
- Experance, z.s.
- EkoLibuš, z. s.
- Evrybáby
- English Playgroup, z.s.
- EVROPANÉ v likvidaci
- Evropské centrum sociální a bezpečnostní výchovy, z. s.
- Elmama,z.s.
- Eltsen Benešov, z.s.
- Evelínka, z. s.
- Evropská numizmatická asociace z.s.
- EURO MASTER OF QUALITY v likvidaci
- el collective z. s.
- EZOP
- Endurance Centrum Mníšek pod Brdy, v likvidaci
- ENERKOM CR spolek
- EEG BIOFEEDBACK INSTITUT v likvidaci
- Energie jinak z.s.
- EUROTEAM CZECH REPUBLIC, z.s.
- Evropské centrum pantomimy neslyšících, z.s.
- Eventer, z.s.
- Eden žije, z.s.
- Experiments.cz, z. s.
- Enviromentalistický zelený kříž, z.s.
- Evropská asociace Sexological Bodywork, z.s.
- EKONS-humanity center Praha v likvidaci
- European Longevity Initiative, z. s.
- ENERKOM Brána Brněnska z.s.
- Ekologické sdružení pro zdravé životní prostředí v likvidaci
- ESTER z. s.
- EURO-BRIDGE z.s.
- EUROPEAN MEDIA ASSOCIATION,o.s.
- ELECTRA-CITY, o.s.
- EUREDA o.s.