- EGREDIOR - Centrum rozvoje zkušenostního učení, v likvidaci
- EKO - AKTIV ZBUZANY
- Ekologické sdružení pro ochranu vzácné fauny a flóry v katastrálním území Rokytno, o.s. v likvidaci
- EPIMELEIA.EU z.s.
- Elíšek, z.s.
- Erudik z.s.
- Embassy poker club o.s.
- Equi Madlen, z.s.
- Eduaventura z.s.
- Edmundova soutězka
- ESOKOL
- Ethical outlook club
- expert KING PINS z.s.
- Equiteam, z.s.
- EURIC, z. s.
- ELDORÁDO, spolek dětí a mládeže
- EduPolis, z.s.
- ECOHOUSING, spolek
- ELEIVANA ResearchLaboratory z.s.p.o.
- EVROPSKÁ ASOCIACE VYMAHATELNOSTI PRÁVA v likvidaci
- ELLA - ROCK
- ENJOY WOOD z.s.
- European Great Commission Collaboration, z.s.
- ELPA - občanské sdružení pro prevenci a rehabilitaci v likvidaci
- Excel z.s.
- Ekologické sdružení občanů obce Ronov nad Sázavou v likvidaci
- Eliščiny jesličky z.s.
- Evangelikální společenství křesťanů, z.s.
- Elektrotechnické výzkumně-vývojové centrum, z.s.
- Ekokoridor
- EFA - fotbal z.s.
- Evangelikální společenství, z.s.
- Evropská Asociace Celostní Muzikoterapie, z. s.
- ELFÍK, o.s.
- e-scuola, z.s.
- ETNA, Centrum pro výzkum etnických a náboženských konfliktů v likvidaci
- European Association of Cloud Service Providers z.s.
- Equita Therapy z.s.
- Ex Post - centrum pro kulturu a vzdělání, z.s.
- EXPEDICE APALUCHA z.s.
- Ecumenical Network for Youth Action
- Evropské hnutí v České republice, z.s.
- Educa Corcontica, z.s.
- Econnect v likvidaci
- EduLec, z.s.
- Evropská projektová agentura, o.s.
- ESN UCT Prague, z.s.
- Evropská asociace průvodců, o.s.v likvidaci
- Educator, z.s.
- Eldorádo Badminton Praha, z.s.