- Enliven Centre, z.s.
- EKO Tuchoměřice
- E.H security gym o.s., v likvidaci
- early reflections
- e-Inkluze spolek pro digitální inkluzi osob znevýhodněných nebo zdravotně postižených, z.s. zkráceně e-Inkluze, z.s.
- Electra - spolek pro regionální rozvoj čisté mobility a energie, z.s.
- Evropský kongres Ukrajinců, z.s.
- EFKÁ JITRO
- EOL realizace z.s.
- Ecclesia podcast, z. s.
- EUROIN občanské sdružení
- Epona Jičín v likvidaci
- EC Lokomotiva Mumie
- EMA Poděbrady, z.s.
- Education42morrow z.s.
- Emily4Life, z. s.
- Evropská společnost pro budoucnost z.s.
- Ejpovice-místo pro život
- EDUCOS o.s.
- EURAPAG, Evropské sdružení gynekologie dětí a dospívajících - European Association of Paediatric and Adolescent Gynaecology
- Ekologické sdružení občanů obce Hřiště u Přibyslavi v likvidaci
- ENDO Talks CZ, z. s.
- Ellinka
- EKO Průhonice v likvidaci
- Ekoport z.s.
- Egéria Kadaň, z.s.
- Evropský orientační atlas
- European Knowledge Institute, z. s.
- Emauzský spolek Gregorius
- ENJOY SPORT KLUB Liberec o.s.
- European Consulting & Service International z.s.
- Eruditio - Spolek pro podporu kultury, vzdělávání a školství na Praze 11
- ELASA CZ
- Ekologicky žít z.s.
- ETNIC ART v likvidaci
- Ekologické centrum EKO-LAND.EU, z.s.
- Effatha, z.s.
- EDUNIKA z.s.
- ESO 97
- E-MOC-E, z.s.
- EDUCA QUALITY, z.s.
- ELEKTROTECHNICKÝ CECH Česká Lípa, z.s.
- EVANGELIKÁLNÍ BAPTISTÉ LOVOSICE, z. s.
- Equipropag o.s. v likvidaci
- European Cyber Security Excellence Center, z. s.
- Ekonom v likvidaci
- European Green Energy z.s.
- Energeticko - vodárenský inovační klastr z.s.
- Enfant Terrible z. s.
- English Summer v likvidaci