- Exthema, spolek pro studium přenosu a zpracování informace
- EPL - BUK z. s.
- Euterpe Philharmonia z. s.
- Extrémní sporty Hodonín z.s.
- EKOTECH - ochrana ovzduší v likvidaci
- Energetické společenství Sousedství Kukleny, z.s.
- EduTrio, z. s.
- EU MOVE z.s.
- Elektrotechnický svaz český, z. s.
- Evangelikální společenství, z.s.
- Endorfin Klub, z.s.
- EVROPAN z.s., v likvidaci
- Evropská komora architektů, z.s.
- EU a My „50 ”
- ECHO-Občanské sdružení pro vzdělání, volný čas a pobyt v přírodě
- EQUUS KUCHAŘOVICE, z. s.
- European tax and law institut
- ELBA Ústí nad Labem o.s. v likvidaci
- Echo Moravia
- eDuše, z.s.
- Explosiw Bike Team
- ELEKTRON, vzdělávací centrum
- Ereignis
- ELITA VK
- e(R)go, z. s.
- ECC 2012, z.s.
- EuroDog Praha v likvidaci
- E.T.H.L.-Polabská liga stolního hokeje v likvidaci
- EKOENTO ČR - sdružení aplikované ekologie o. s. v likvidaci
- Ensemble Hilaris z.s.
- EURO-BRIDGE z.s.
- Evropský regent, z. s.
- ENTRANCE GALLERY
- Experti na dluhy, o.s.
- Educators, z.s.
- Evita Romano
- ELBERETH ROCK
- E.R.S. (EXTREME RESCUE SQUAD)
- EK-OÁZA
- ENERKOM Česko z. s.
- EPIGON, Vimperk v likvidaci
- Evropská komora nucených, exekučních a konkurzních správců a likvidátorů, o.s.
- Energis 24
- ENERKOM Moravská cesta, z. s.
- EUROPE CLUB LITOMYŠL, z.s.
- Evropské poradenské a informační centrum Olomouc "v likvidaci"
- EKOFEST z.s.
- Euro Metalwork Association, z.s.
- EVANGELIKÁLNÍ BAPTISTÉ JABLONEC, z.s.
- English and Garden, z.s.