- Ebed, z.s.
- Eastern Culture
- Elipsa v likvidaci
- EKOVESNICE z.s.
- EFEKT DANCE BRNO, z.s.
- ESKO-SW, z.s.
- ESN MENDELU Brno z.s.
- ELPIDA
- EC - OLI PARTNER, o. s.
- Eastside Fighters Gym z.s.
- Echo Moravia
- Edata-base,o.s.
- ENDURO SPORT PLZEŇ z.s.
- East Tennis Club spolek
- Etické fórum České republiky, z.s.
- EGREDIOR - Centrum rozvoje zkušenostního učení, v likvidaci
- Eccentric Club, z. s.
- Ein Gedi, z. s.
- Educators, z.s.
- Elenia, o.s.
- Ellis tk Svitavy
- EDU - ARCUS
- ENERKOM Slovácko, z. s.
- Ekologický spolek Na Klášterce, z.s.
- Evropský finanční institut
- Evropský klub
- Edu-Act z.s.
- Equiteam, z.s.
- Edoras Estel - společenství přátel a bližních Estelinoru v likvidaci
- Energie pyramidy z.s.
- Ecospolek,z.s.
- Edu 2023, z.s.
- Ernesta Club Lipno, z.s.
- Ekipa, z.s.
- Evropsko-čínská asociace pro kulturní, hospodářskou a obchodní výměnu z.s.
- EKOENTO ČR - sdružení aplikované ekologie o. s. v likvidaci
- European OUTLET Association, o.s.
- Evropský svaz seniorů, z.s.
- EQUIS o.s.
- Expert Tuning Club Prostějov, o.s. v likvidaci
- European Hockey Clubs Union z. s.
- Elektromobilní platforma, z.s.
- European Health & Beauty & Wellness Association
- Evropský institut pro povrchové úpravy
- EUROMEDIVAN - First Aid Medical Service z.s.
- Eurorestart z.s.
- EQUITEAM OBORA, z.s.
- ECOPOLIT, o.s.
- Eruditio - Spolek pro podporu kultury, vzdělávání a školství na Praze 11
- Élie z.s.