- ESPERAS, z.s.
- Ethio-Czech Community z.s.
- Ekologie Beskydy
- Edu-Act z.s.
- Eco X, z.s.
- Ec chajim, z.s.
- EDUCA-MB občanské sdružení
- EKO POINT v likvidaci
- Equipropag o.s. v likvidaci
- Extrémní sporty Hodonín z.s.
- Eltossport Praha v likvidaci
- EUROASIA v likvidaci
- ESPEDIENTE, z.s.
- Equiteam Doloplazy, z.s.
- E FOR YOU, z.s.
- ESN MENDELU Brno z.s.
- EXIL, z. s.
- EduZa z.s.
- Equi Academy z.s.
- ENVI & CULTURE INSTITUTE z.s.
- Evropská síť klinického právního vzdělávání, z.s.
- Extreme trail park Vinaře, z.s.
- ECCE TISOVÁ, z.s.
- Ecce Homo Šternberk, z.s.
- Equichannel.cz v likvidaci
- ELEVEN-RUBENA TEST TEAM
- Expedito z.s.
- EduFarma, z. s.
- Ekologické sdružení soukromě hospodárných rolníků a podnikatelů okresů Havlíčkův Brod a Žďár nad Sázavou v likvidaci
- Ekwo Club
- ELATER v likvidaci
- Euroinstitut
- Error, o. s.
- ERASMUS a COMPANY v likvidaci
- Evropsko - africká asociace pro rozvoj Česká republika
- ELIM Pardubice, křesťanská společnost pro diakonii, z. s.
- EBB STAVBY
- ERGO-Společnost pro zvyšování životní úrovně v likvidaci
- Elánek pro rodinu, z.s.
- ELMI - Spolek přátel elektronové mikroskopie
- Eupathia, z.s.
- Ebed, z.s.
- EuroTREND 2000
- Elektrotechnický svaz český, z. s.
- Energie pro všechny
- E Center
- Evropský institut pro rozvoj lidských zdrojů
- Emmaus Praha v likvidaci
- Edu4life, o. s.
- Elektrotechnický cech podnikatelů ve výstavnictví a elektromontážní činnosti v likvidaci