- ELEMENTARIUM z. s.
- EKOFORUM v likvidaci
- Esence života z.s.
- Ekologický spolek Na Klášterce, z.s.
- EKKO, Jablonec nad Nisou
- Ekologické sdružení Zahrada Moravy Boršice, z.s.
- Eda Nezbeda a spol., z.s.
- Exclusive Fitness Šibeniční vrch
- E.WRC euro moto club
- eKultura, z.s.
- Ekologické Jinonice v likvidaci
- Ef osm z.s.
- Ecce Homo Pedal, spolek
- Edata-base,o.s.
- EquusPro z.s.
- Evropská síť klinického právního vzdělávání, z.s.
- Eduteam-centrum celoživotního vzdělávání z.s.
- E Bodyvital, o.s. "v likvidaci"
- EKO OBORA HVĚZDA v likvidaci
- Expertní komora kariérového poradenství, z.s.
- Escala, z. s. v likvidaci
- EUROASIA v likvidaci
- EVA - European Virtual Association
- ELVIS GYM,o.s. "v likvidaci"
- EUVIET
- Envio, z.s.
- Enigma Animals z.s.
- Evropská Asociace pro Bezpečnost & Prevenci z. s.
- ERBIA Student Club z.s.
- eReS tým ČR z.s.
- European town development, o.s.
- Epiphany z.s.
- Elektrotechnické výzkumně-vývojové centrum, z.s.
- EERINESS, z. s.
- EVROPSKÁ KOMISE PRO MIGRACI,AZYL,INTEGRACI,OCHRANU PRÁV CIZINCŮ A NÁRODNOSTNÍCH MENŠIN,o.s. v likvidaci
- Ekologické sdružení občanů obce Ronov nad Sázavou v likvidaci
- EQUINIKI o.s.
- Ekocamp Jeseníky, z. s.
- ELSA Olomouc, z. s.
- EXERGIE v likvidaci
- Evoluce - Jihočeské centrum českého znakového jazyka z.s.
- EnduroCross S-Dvůr, z.s.
- EXTREM TEAM VYSTRKOV, o.s.
- ExperiPent, z. s.
- Evropská Asociace Sundo, z.s.
- Evropská diplomatická komora
- EverHome, z.s.
- EkoTOZ o.s.
- EFMD Global Network Central and Eastern Europe, z.s.
- Erasmus Student Network Ústí nad Labem, z.s.