- Evropská projektová agentura, o.s.
- EquiTeam Bohemia, z.s.
- Extreme Club, z.s.
- EduRegio, z.s.
- Easystuding,o.s.
- ELITE PRAHA, z.s.
- ENERSOL CZECH, z. s.
- Europe, be brave, z. s.
- ESN Pardubice z.s.
- Evropské Integrační Centrum z.s.
- Evropský obchodní a diplomatický klub Praha v likvidaci
- Evropské sdružení právníků,o.s.
- EDU Effective, z.s.
- EOL energy z.s.
- ECC 2012, z.s.
- Eliška, o.s.
- ESTinstitute, z.s.
- Equestrian Archery Czech Republic, z.s.
- Excel z.s.
- Ekologická tolerance
- Educa Bohemia z.s.
- EduFarma, z. s.
- eLaborka, z. s.
- Estrela verde
- Eligius z.s.
- Evropské centrum tradiční čínské medicíny z.s.
- EP Kids, z.s.
- Evropská federace aplikovaných pohybových aktivit, z.s.
- Extreme Trail Czechia, z.s.
- EXPEDITION CAMERA CLUB, Z. S.
- ETORDA O.S.
- Ekologické sdružení Pořežín v likvidaci
- Elevate registry solutions z.s.
- EPO1, z.s.
- Euro Business Association, z.s.
- English and Garden, z.s.
- Ekologické centrum EKO-LAND.EU, z.s.
- European Center for Civic Initiatives, z. s.
- Eduard Šmidt-Karate Club z.s.
- ENERKOM Opavsko, z.s.
- Europe Ambulance Service z.s.
- Egéria Kadaň, z.s.
- Erudik z.s.
- Enduro team Horažďovice, z.s.
- EKOmysl, z. s. "v likvidaci"
- EKON v likvidaci
- EquiTeam, CZ v likvidaci
- ERA - European Rescue Academy z.s.
- EPICentrum-Strakonice z.s.
- Emilova sportovní, z.s.