- East Tennis Club spolek
- EOL energy z.s.
- Ergo Vitalis z.s.
- EUNOMIE
- Elektrotechnický cech Tachov z.s.
- Euterpe Philharmonia z. s.
- Élie z.s.
- ELLA - ROCK
- eGON ACADEMY, občanské sdružení pro rozvoj eGovernmentu v České republice
- EDUKRATES z.s.
- EDUHELP, z. s.
- Ekonomický tým II, o. s.
- EQUI MORAVIA z.s. "v likvidaci"
- Ekologické sdružení pro zdravé životní prostředí v likvidaci
- EUROPA výchovné a vzdělávací centrum
- Evropské centrum sociální a bezpečnostní výchovy, z. s.
- Educat Kutná Hora z. s.
- England Revolution, z.s.
- EDUCOM/SPORT z.s.
- E16100 z.s.
- Exkurzní oddíl Varnsdorf, z.s.
- EXTREMEDEER o.s.
- EFAS - sdružení pro ochranu a záchranu zvířat v tísni "v likvidaci"
- EURYBIA YACHT CLUB z.s.
- Epistea, z. s.
- EKOCENTRUM Pod Marjánkou, z. s.
- ELCY - Elektrocyklisté, z. s.
- Edulink
- European People & Media z.s.
- Esence zdraví, z.s.
- Ekolidé
- ELECTRA-CITY, o.s.
- Eskimák sports
- Ekola Praha
- Ekologický spolek Horní Bříza, z.s.
- Ernesta Club Lipno, z.s.
- Equita Therapy z.s.
- Eutropia z.s.
- ENDURO ZÁBŘEH, z.s.
- Evropský orientační atlas
- EDUCATIO, z.s.
- ENVIRA v likvidaci
- ELEKTROTOP, v likvidaci
- EMA z. s.
- Euro TRANS Association, z.s.
- EXCO TŘINEC "v likvidaci"
- East Hawks
- Ekumenické forum křesťanských žen v České republice
- enterra - výzkum, vzdělávání, komunikace, profesní podpora
- Exthema, spolek pro studium přenosu a zpracování informace