- EURO-BRIDGE z.s.
- Evropan - ochrana práv oprávněných osob, zapsaný spolek z.s.
- Evangelikální sbor Immanuel z.s.
- EPIC Sport Šternberk, z.s.
- Evropská komora nucených, exekučních a konkurzních správců a likvidátorů, o.s.
- EXTREMEDEER o.s.
- E.R.S. (EXTREME RESCUE SQUAD)
- Elektrotechnický cech Písecka
- Euripidia Educa, z. s.
- European Association of Project Managers, z.s.
- E - SERVIS v likvidaci
- ESKIMO CHLUMEC z.s.
- Epic crew z. s.
- EPEKA CZECH z.s.
- Élektra, z.s. - Centrum pomoci ženám sexuálně zneužitým v dětství
- ENVERO, z.s.
- European Profi Medical Association, z.s.
- Evropská komora architektů, z.s.
- Ekoinfo Palouček
- Energetické společenství pro Triangle, z.s. v likvidaci
- ESET
- Ekocamp Jeseníky, z. s.
- EKOHUBERT z.s.
- Evropská unie námořního jachtingu
- Ekologické sdružení občanů Psár u Prahy v likvidaci
- EquiTeam Bohemia, z.s.
- ELPIDA
- European Student Organisation z.s.
- Eurodidakt o.s.
- Evropské sdružení zvířecích útulků, o.s. v likvidaci
- EVROPAN z.s., v likvidaci
- EUnity z. s.
- E-commerce & Tech cluster, z.s.
- ELDEN Brušperk, z.s.
- Edova cesta z.s.
- EXTRALIGA MASTERS, spolek
- Educate z. s. v likvidaci
- Evropská unie umění z. s.
- European Medical Phototherapy and Esthetics Association, z.s.
- ELAIA z.s.
- ENERGY JUDO TEAM, z.s.
- European Association of the Disabled z. s.
- EKOGEN, o.s.
- Eko - plus, o.s.
- Evropské centrum pro mithraistická studia, z.s.
- EKO Kuří v likvidaci
- ENDURO ŠKOLA PROMOTO
- European Network of Central Asian Journalists, z.s. v likvidaci
- ETNA - ŠKOLSTVÍ
- EXOTA Malé Svatoňovice, zapsaný spolek