- Elpis, z.s.
- Eklub.cz z.s.
- Exel team z.s.
- Eastwicked Promotion z.s.
- EUnity z. s.
- Evropská diplomatická komora
- Evropské společenství Slovanů sv.Cyrila a Metoděje v likvidaci
- EVEREST, spolek Vrbno
- Edu Brno, z.s.
- Evita z. s.
- Edufundraiser, z.s., v likvidaci
- Europe Ambulance Service z.s.
- Equi Minice z.s.
- Eufour, o.s.
- EURO GOLF CLUB Karlovy Vary
- Experance, z.s.
- Evropská liga pro ochranu lidské důstojnosti, z.s. v likvidaci
- Equittana - azyl z. s.
- Eretz o.s.
- ENERKOM Bobrava, z.s.
- EOL industry z.s.
- Elenia, o.s.
- Electra - spolek pro regionální rozvoj čisté mobility a energie, z.s.
- Evropská komora architektů, z.s.
- EuroCentrumHelp z.s.
- Euro Poker Club o.s.
- Elis koně z.s.
- Eywan 2010, z. s.
- Elipsa v likvidaci
- EquiTeam, CZ v likvidaci
- Envio, z.s.
- EDAOS, z.s.
- EOL energy z.s.
- EL Pako z.s.
- Eventing Team z.s.
- Euro federation hockey and football
- ECL 2002 (1st European Conference on Landslides 2002)
- European Knowledge Institute, z. s.
- EKKO, Jablonec nad Nisou
- Evropská unie námořního jachtingu
- Erasmus Student Network MUNI Brno, z. s.
- ELIM Ostrava, spolek
- EPRA
- Evropské společenství občanů 2000, v likvidaci
- ELSA Česká republika, z.s.
- Eddie Association, z.s.
- Ensemble Guillaume v likvidaci
- Equi Academy z.s.
- Easyfree "v likvidaci"
- EVOLVE GLOBAL, z. s.