- eSsential e-sports team
- EQUIFEED TEAM z. s.
- EURO HOCKEY
- EQUIS o.s.
- EVROPSKÉ DĚTI-CHILDREN OF EUROPE
- EPC-klub, z.s. v likvidaci
- EDU-SCHOOL CONSULTANT, z. s.
- Eufrat, česko - irácké sdružení pro rozvoj, kulturu a vzdělání, v likvidaci
- EducenStep z. s.
- E.H security kick-box gym, z.s.
- Esence CZ
- Emilova produkční, z.s.
- ESKO-SW, z.s.
- EDUCA QUALITY, z.s.
- Educenter Komunita Praha 5 z.s.
- EKOhaus Třebíč, z.s.
- Ekojóga České republiky, zapsaný spolek
- ECOPOLIT, o.s.
- Ekologické Sdružení Občanů Stodůlek a Řeporyj, v likvidaci
- ENERGY CLUB
- Elánek KIDS z.s.
- eD Sport Team, z. s.
- Educa Corcontica, z.s.
- English and Garden, z.s.
- Elen world, z.s., v likvidaci
- ECOsmile, z.s.
- Euro Queer Edu Czech Republic, z.s.
- ESSENTIAL CLUB
- Educationem pro prosperitas o. s.
- Educate z. s. v likvidaci
- Evropsko - africká asociace pro rozvoj Česká republika
- Energie2050 z. s.
- Expedito z.s.
- ELITÉ OSTRAVA z. s.
- EFFE DUE CZECH MASTERS TEAM
- Ekologické sdružení Lískový dvůr
- Element pohybu, z.s.
- EERINESS, z. s.
- EQUI KLUB PASTUCHOVICE, z.s.
- Espirito Santo, z.s.
- ELBERETH ROCK
- Ekologické sdružení pro ochranu vzácné fauny a flóry v katastrálním území Rokytno, o.s. v likvidaci
- E-Lingvo o.s.
- Euro-iránské centrum obchodního rozvoje, z.s.
- Ekocentrum BESKYDY
- EASY Live z. s.
- ERKO Esports z. s.
- Equilibro, z.s.
- ENERGY CONSULTING z.s.
- ENTROTERRA, o.s.