- Expedition Club International z.s.
- Evita Romano
- European Ice School z.s. v likvidaci
- EKO BŘEVNOV z.s.
- Ecola Equestrian, z.s.
- Evropská mezinárodní tisková agentura, z.s.
- eKultura, z.s.
- EXPEDITA z.s.
- Elite Sport Boskovice, z.s.
- EQUS GLACENSIS v likvidaci
- Educa Socio House z.s.
- Eduard Šmidt-Karate Club z.s.
- ELEMENTARIUM z. s.
- Expedial
- Evropské centrum pro mithraistická studia, z.s.
- Ekologické sdružení občanů obce Ronov nad Sázavou v likvidaci
- EURO KONGRES Liberec
- EuroClaim Consulting, o.s., v likvidaci
- ENERGOUNION z.s.
- EKOENTO ČR - sdružení aplikované ekologie o. s. v likvidaci
- EnTrée, z.s.
- ELCY - Elektrocyklisté, z. s.
- Ekocentrum Vřesoviště, z.s.
- EOS DIVUM z.s.
- ENDURO TRAŤ DŘEVOHOSTICE, spolek
- EURION, z.s.
- eXtatus o.s.
- ENERSOL CZECH, z. s.
- Evropský dům v Brně v likvidaci
- Equilibrium Eventing z.s.
- Evropská komora architektů, z.s.
- ENJOY RIDING TEAM z.s.
- EURAG - Česká republika v likvidaci
- Ex Post - centrum pro kulturu a vzdělání, z.s.
- e-scuola, z.s.
- European Society of Investors in Natural and Social Sciences Research, z.s.
- Event media sport z. s.
- Experti na dluhy, o.s.
- Ekola Praha
- ELMI - Spolek přátel elektronové mikroskopie
- EPEO
- Esence života z.s.
- Ethio-Czech Community z.s.
- ERA Česká republika, z.s.
- Enduro Cross Club Austerlitz, z.s.
- Educa Bohemia z.s.
- ESPEDIENTE, z.s.
- Evropská unie pro lidská práva, z.s.
- Excel z.s.
- EDU-DOOR, z. s.