- Ekologická farma Brčálník
- Evropská liga pro ochranu lidské důstojnosti, z.s. v likvidaci
- Enkidu, z.s.
- Ernestina v likvidaci
- EZOP
- Elements Community, z. s.
- EKO centrum Srdov
- Etické fórum České republiky, z.s.
- ELATER v likvidaci
- ENERKOM Růže, z.s.
- EduFarma, z. s.
- ELBERETH ROCK
- Euroregion Šumava - jihozápadní Čechy, z. s.
- Egyptian Front z. s.
- EMDEST
- Ekumenické sdružení občanů
- EmiHraní, z. s.
- EURO PRAGENSIS ARS v likvidaci
- E - demokracie v likvidaci
- EDUKRATES z.s.
- EVROPAN z.s., v likvidaci
- EU a My „50 ”
- Energetické společenství SVJ J. Glazarové 25, Olomouc z. s.
- Esence života z.s.
- ETNIC ART v likvidaci
- ENJOY WOOD z.s.
- EKO VENKOV, z.s.
- Ekwo Club
- eAKTIVITA z.s.
- EUROPEAN MEDIA ASSOCIATION,o.s.
- Elite Gym Radiměř z.s. v likvidaci
- EURAPAG, Evropské sdružení gynekologie dětí a dospívajících - European Association of Paediatric and Adolescent Gynaecology
- EKOPARK z.s.
- EUTERPE, z.s.
- EntEra Society, o.s. v likvidaci
- Ekocentrum Poustka z. s.
- Equi Academy z.s.
- ENERKOM Brána Brněnska z.s.
- Ekologické sdružení pro ochranu vzácné fauny a flóry v katastrálním území Rokytno, o.s. v likvidaci
- Educato, občanské sdružení
- Energeticko - vodárenský inovační klastr z.s.
- European Association of Education, z.s.
- EvetData, z. s.
- ENERKOM Písecko z.s.
- Edukana, spolek
- Evropská Aliance pro Rozvoj Podnikání z. s.
- ELFÍK, o.s.
- EKO - Proskovice
- Elpis, z.s.
- Evropské centrum ekonomických vztahů