- EMA z. s.
- EQUIS o.s.
- enterra - výzkum, vzdělávání, komunikace, profesní podpora
- Erebia, z. s.
- Evropská akademie designu v likvidaci
- EDAOS, z.s.
- EPEO
- Enduro klub Zaječov, z.s.
- Ekologický servis Praha
- Equita Therapy z.s.
- Ekwo Club
- Élie z.s.
- Elvíra z.s.
- Environment and Wetland Centre, z.s.
- EEG BIOFEEDBACK INSTITUT v likvidaci
- Evropská unie z.s.
- Ekologicko energetické forum
- EWSC Praha, z. s.
- EXPEDITA z.s.
- European Security Association
- Elite Lhenice, z.s.
- Elitebikes One Energy, z. s.
- EXTRÉMNÍ SPORTY z.s.
- Evropský institut pro udržitelný rozvoj, z.s.
- Extreme Dogs, z.s.
- Evropská akademie transpersonální psychologie a bioenergetických věd
- Evropská Aliance pro Rozvoj Podnikání z. s.
- EUROPE4UKRAINE, z. s.
- Edu4life, o. s.
- EQUIJUMP Líšnice z.s.
- EDAS, o.s.
- EBERESCHE z.s.
- Empatie
- EQUICENTRUM - Jaroměř z.s.
- EDUCAMED, o.s.
- EFI - FOR ANIMALS z.s.
- ECCE HOMO v likvidaci
- ERIK (Evropský Romský Informační Klub)
- Energy Centrum Praha o.s.
- Elektrotechnický cech České Budějovice
- ESN Charles University Prague, z. s.
- ENDURO LITOMĚŘICKO, z.s.
- EcoNet CENTRUM
- Elektrotechnický cech okresu Náchod v likvidaci
- ENERKOM Plzeňsko, z.s.
- ErnetFree
- Ehlers - Danlosův syndrom a syndrom hypermobility, z. s.
- EMILAK KART KLUB Čejč
- Ex Post - centrum pro kulturu a vzdělání, z.s.
- EKO Kuří v likvidaci