- Energie2050 z. s.
- Euroregion Pomoraví, spolek
- EDUPLAY, z.s.
- EduLaw, z.s.
- EFATA z.s.
- Elánek pro rodinu, z.s.
- EKOMA poradenské centrum z.s. "v likvidaci"
- ERÍNYE v likvidaci
- Elektrotechnický cech České Budějovice
- Evropa doma z.s.
- ENVIA "v likvidaci"
- EVROPSKÉ SDRUŽENÍ PRO PODPORU TRADIC VENKOVA O.S.
- E-Lingvo o.s.
- EVROPSKÉ CENTRUM ROMSKÉ KULTURY V PRAZE v likvidaci
- EMT SPORT, občanské sdružení
- Ekologické sdružení pro zdravé životní prostředí v likvidaci
- Evropské společenství občanů 2000, v likvidaci
- EK RACING z. s.
- EŽ BOWLING GLADIATORS
- Excellence Network
- EDUPEAN, o. s.
- Equilibrium, o.s.
- Enduro team Horažďovice, z.s.
- EHK karate club z.s.
- EKOLOGIE PRO ŽIVOT o.s.
- ES-KA veterán klub
- Educatis, z.s.
- ENERKOM Písecko z.s.
- ENERKOM Slovácko, z. s.
- Equus Bohemia, z. s.
- ESN Pardubice z.s.
- EDC spolek
- Edurikon, zapsaný spolek
- Experance, z.s.
- Extreme sports association o.s.
- ELBERETH ROCK
- Etriatlon Team, z.s.
- Evropský Institut pro východní partnerství o.s.
- Eventum Education z. s.
- European Knowledge Institute, z. s.
- Elektroretro z.s.
- Ecce Homo Pedal, spolek
- EMOTER - Essential Medical Outreach & Treatment Rescue, z.s.
- Ekocentrum Budař z.s.
- EUROPEAN AID ORGANIZATION, z. s.
- Euro TRANS Association, z.s.
- EkoLibuš, z. s.
- Expeditio Germanica, z.s.
- ESTinstitute, z.s.
- EPC-klub, z.s. v likvidaci