- Evropská asociace pro rozvoj všeobecného letectví,z.s.
- EKOPROVERA o.s.
- ENVIROP Care, z. s.
- Energeticko-technický inovační klastr, z.s.
- EDI, z.s.
- EUROFREETIME, z.s.
- EduCare
- Ekocamp Jeseníky, z. s.
- Ensemble Opera Diversa, z.s.
- Eko Arts Studio, z.s.
- EKOBIO v likvidaci
- ETC Orlík
- Elpizo z.s.
- EPS aktivity, z.s.
- Euro Tourist Club o.s.
- EduShield, z. s.
- ELEKTROTECHNICKÝ CECH Česká Lípa, z.s.
- Energie pro každého
- Ekocentrum Blansko
- Enduro team Horažďovice, z.s.
- EURO-BRIDGE z.s.
- Expeditio Germanica, z.s.
- Emerik Blum, z.s.
- eAKTIVITA z.s.
- Euro Metalwork Association, z.s.
- EKO Trend o.s. "v likvidaci"
- Ekoregion Úhlava, z.s.
- Ekologické Sdružení Občanů Stodůlek a Řeporyj, v likvidaci
- Erasmus Student Network Zlin, z.s.
- Emergency Extreme, z.s.
- EquiAthlete, z.s.
- Ein Gedi, z. s.
- Eurythmea z.s.
- EVROPSKÉ CENTRUM ROMSKÉ KULTURY V PRAZE v likvidaci
- ÉRA ŽEN, z.s. v likvidaci
- EKOGROUP, občanské sdružení, v likvidaci
- Ekocentrum Poustka z. s.
- Elite-fitness Gym Sušice
- ESN UCT Prague, z.s.
- EXPERO, z.s.
- Eldorádo z.s.
- E - SERVIS v likvidaci
- EUROS
- EduRegio, z.s.
- ETORDA O.S.
- EQUI KLUB PASTUCHOVICE, z.s.
- Ekologická iniciativa TRAVEX v likvidaci
- EDUFUN, z.s.
- European Hockey Clubs Union z. s.
- Evropský výbor pro odhalování kriminality a migraci osob z.s.