- EPI 99, z.s.
- EKOENERGOREGION
- Evropská asociace finančních poradců, z.s. v likvidaci
- Eldorádo z.s.
- Educalink o.s.
- EMPATHIA z.s.
- ERASMUS a COMPANY v likvidaci
- EUROIN občanské sdružení
- Ekologie Beskydy
- Erasmus Gathering, z.s.
- EURO KONGRES Liberec
- ECCE TISOVÁ, z.s.
- ÉRA sport Litomyšl
- Extreme Club, z.s.
- EUROPEAN B´NAI B´RITH ASSOCIATION z.s.
- Emilova produkční, z.s.
- Enduro Boars, z.s.
- Evropská Asociace Celostní Muzikoterapie, z. s.
- Ekologické sdružení Lískový dvůr
- Evropská akademie designu v likvidaci
- Eduking, z.s. v likvidaci
- Edu 2023, z.s.
- ENERGY JUDO TEAM, z.s.
- Education for Employment, z.s.
- Erudito, z. s.
- eXtatus o.s.
- Eerste Tsjechisch - Nederlandse v likvidaci
- Erasmus Student Network UP Olomouc, z.s.
- Excel z.s.
- Elektrotechnické muzeum Zubrnice
- ENERGY CLUB
- Euro-Gulf Information Centre Czech Republic, z.s.
- Energetická regionální komunita Podbrněnsko, spolek
- European Su Jok Institute, z. s.
- Eddie Association, z.s.
- Ekologický spolek Na Klášterce, z.s.
- Evropské společenství občanů 2000, v likvidaci
- ENERKOM Moravská cesta, z. s.
- E-commerce & Tech cluster, z.s.
- EXTRÉMNÍ SPORTY z.s.
- Egyptian Front z. s.
- Ekipa, z.s.
- Element pohybu, z.s.
- EXTREMEDEER o.s.
- Elpizo z.s.
- EraYouth z.s.
- Evropa v regionu z.s.
- EM metal fond z.s.
- ECO CLUB - 1. Czech ecotourism club v likvidaci
- Esedra z.s.