- Endorfin Klub, z.s.
- Ensemble Guillaume v likvidaci
- Educationem pro prosperitas o. s.
- EDUCATORIO, z.s.
- EuroTREND 2000
- Edukado - spolek pro vzdělávání
- Energetické společenství ČR - EnSpoČR, z. s.
- Ernesta Club Lipno, z.s.
- Energeticko - vodárenský inovační klastr z.s.
- EDUFUN, z.s.
- EKOCENTRUM Pod Marjánkou, z. s.
- EFPC, z.s.
- EDUM, z.s.
- ENERKOM Moštěnka, z.s.
- Ekoklub Pampeliška, z.s.
- Enduro team Coufal z.s.
- EUROFREETIME, z.s.
- expert KING PINS z.s.
- Ethical outlook club
- EUROPEAN SAMBO UNION, v likvidaci
- ELSA Plzeň, z.s.
- ELEKTROTECHNICKÝ CECH REGIONU OSTRAVA, z.s. "v likvidaci"
- EUVIET
- Equilibrium Eventing z.s.
- Expedice žití z.s.
- Equilibro, z.s.
- EXOPLANT - Česká společnost pěstitelů exotických a vzácných rostlin
- EUROPROSPECT z. s.
- ELCY - Elektrocyklisté, z. s.
- Entre Sociale z.s.
- Effatha, z.s.
- Ensemble Inégal z. s.
- EUROIN občanské sdružení
- E.WRC euro moto club
- EPEO
- Emberiza, z.s.
- EX TEMPORE COMMUNITAS, z.s.
- EG Futsal Ostrava o.s.
- Elab team, z.s.
- Ervěnické divadlo
- Eco Futura z.s.
- EQUS GLACENSIS v likvidaci
- Energie jinak z.s.
- European Network for Financial Education, z. s. v likvidaci
- EUROFOAM SPORT TEAM
- Elipsa v likvidaci
- ENZE z.s.
- EQUI MORAVIA z.s. "v likvidaci"
- European Photo Association, z.s.
- ELKA Ostrava z.s.