- ELSPOL BULLDOGS o.s.
- Emerik Blum, z.s.
- Evangelikální společenství, z.s.
- EUROBURZA
- Ekocentrum Zulejka, z. s.
- Excel z.s.
- Egeria, z. s.
- Ecce Homo Pedal, spolek
- Europe Ambulance Service z.s.
- Eurokennel Club z.s.
- EVTA, o.s.
- ELMI - Spolek přátel elektronové mikroskopie
- EURO HOCKEY
- EARTHLINKS, v likvidaci
- Edufundraiser, z.s., v likvidaci
- EduZa z.s.
- Energetická rada České republiky pro OZE z.s. v likvidaci
- EILAND z.s.
- EETiger, z.s.
- Europa Club Brno, o.s.
- ESKO-SW, z.s.
- Evropský dům v Brně v likvidaci
- Educatis, z.s.
- ENERKOM Růže, z.s.
- Eko for 4
- Elektromontáže pro Ústecký kraj z.s.
- EUROPEAN SAMBO UNION, v likvidaci
- EMCC Czech Czechia & Slovakia, z. s.
- Enduro klub Šumperk
- Ekologie a aktivita o.s. v likvidaci
- Evropská asociace finančních poradců, z.s. v likvidaci
- Ekologická společnost Vlast
- ENVIROP Care, z. s.
- Evropský institut, z. s.
- Exit, o. s.
- Ekologicko energetické forum
- expert KING PINS z.s.
- EUNE
- EPS aktivity, z.s.
- EDU Rožnov z.s.
- Evropský výbor pro odhalování kriminality a migraci osob z.s.
- Energis 24
- ERBIA Student Club z.s.
- Exotický Ráj Foundation z.s.
- ENERKOM Česko z. s.
- Edukační centrum ES CZ
- EverHome, z.s.
- European Cross-Training Association
- Esence CZ
- Evropské sdružení zvířecích útulků, o.s. v likvidaci