- English Learning Centre o.s. v likvidaci
- EKKO, Jablonec nad Nisou
- EUROPEAN POLE DANCE FEDERATION, z.s.
- EUROPEAN WOMEN IN SPORT, z. s.
- Ernesta Club Lipno, z.s.
- EXTREME SPORT CLUB
- Erudikum, z.s.
- Ekologie v praxi, z.s.
- EduLec, z.s.
- E.H security kick-box gym, z.s.
- EuroPartner
- ECCE TERRA
- ENERKOM Moštěnka, z.s.
- EDUCO - CENTRUM PRO LÉČEBNĚ - PEDAGOGICKOU JÍZDU NA KONI A VOLTIŽ
- Emmaus Praha v likvidaci
- ERUDIO CZ, z. s.
- European Educational Cannabis Clinic, z.s.
- EDUPEAN, o. s.
- Eye-T.cz, z. s.
- EKS dance company z.s.
- EduMeda z.s.
- ELLENI z.s.
- Edu Brno, z.s.
- Elab team, z.s.
- European Council of Autistic People z. s.
- European Science and Art Publishing, z.s.
- EVANGELIKÁLNÍ BAPTISTÉ JABLONEC, z.s.
- EURO GOLF CLUB Karlovy Vary
- ERA Česká republika, z.s.
- EK RACING z. s.
- Ekologické hnutí Gréta, z.s.
- EUROPEANA HANDICAP, z.s.
- Euro-Gulf Information Centre Czech Republic, z.s.
- EDU CAS LOVE, z. s.
- ENERGY CLUB
- Equilibrium Eventing z.s.
- EC Lokomotiva Mumie
- ELSA Praha, z.s.
- ERKO Esports z. s.
- Elen world, z.s., v likvidaci
- ENTRANCE GALLERY
- ESN Charles University Prague, z. s.
- E - PROJECT o. s., v likvidaci
- EQUUS SPORT z.s.
- European Ladies Association, o.s.
- Extremsport Olomouc
- Erasmus Student Network VŠTE Budweis, z.s.
- Eklub.cz z.s.
- Evropský literární klub v likvidaci
- EDURETIA v likvidaci