- EDUSCOPE CZECHIA, z.s.
- Enviopress o.s.
- EduFOX z.s.
- Edu Brno, z.s.
- Euro Business Association, z.s.
- Edurikon, zapsaný spolek
- Eager Swingers o.s.
- ENERKOM Brána Brněnska z.s.
- Ernest Rascal
- EKOFORUM 2001
- Energický spolek
- English Learning Centre o.s. v likvidaci
- Extremsport Olomouc
- E-Bridge, z.s.
- End Duchenne z.s.
- ESSENTIAL CLUB
- Ebenezer z. s.
- Equi Minice z.s.
- Evropský klub Benešov
- Ekostream o.s.
- European Golf & Country Club, z.s.
- Experiments.cz, z. s.
- Eduino, z.s.
- Egéria Kadaň, z.s.
- EVROPSKÁ KOMISE PRO MIGRACI,AZYL,INTEGRACI,OCHRANU PRÁV CIZINCŮ A NÁRODNOSTNÍCH MENŠIN,o.s. v likvidaci
- Evropa v regionu z.s.
- EFCHARISTO z.s.
- Early Education o.s.
- EU-ROZHLED
- Eduard Šmidt-Karate Club z.s.
- EMPONA z. s.
- EU-LEX, z.s.
- European Hockey Academy, z.s.
- Ekologické Sdružení Občanů Stodůlek a Řeporyj, v likvidaci
- EVROPSKÉ DĚTI-CHILDREN OF EUROPE
- Elektrotechnický svaz český, z. s.
- European DanceSport Union
- Eko Znojmo - Louka
- ERAWAN GYM
- Elánek z.s.
- E FOR YOU, z.s.
- Ekologická iniciativa TRAVEX v likvidaci
- Equiteam, z.s.
- EXPERIENCE
- Evropská unie námořního jachtingu
- ELTRAV CZ 2013 v likvidaci
- ELC Cesta Slezsko z.s.
- EILAND z.s.
- Evropská asociace na podporu zdraví, o.s.
- edu solution z.s.