- Equi Academy z.s.
- Eastwicked Promotion z.s.
- Ensemble Inégal z. s.
- Ecce Euro Educa na pomoc osobám sociálně potřebným,osobám s různými
- Evropský Institut Profesního Vzdělávání v likvidaci
- ELECTROTECHNICAL CLUSTER, z.s.
- Edutera z.s.
- Europen Dumplink v likvidaci
- EUROPEAN DIGITAL MARKETING INSTITUTE z. s.
- Evropské regiony
- EUSIS - EUROPE START - UP - IMMIGRANT, o.s.
- Epona Jičín v likvidaci
- Ekologicko Technologický Park Milenovice
- Eligor Krampus z.s.
- Easy Jump Team z.s.,
- EkoHrádky z.s.
- EU - Kontinent pro děti
- ESPEDIENTE, z.s.
- Ekonomicko-politický institut
- EUROPEANA HANDICAP, z.s.
- Evropská komora módních návrhářů, z.s.
- EUROPA ALMA MATER
- Ecopulse CZ, z.s.
- EduRegio, z.s.
- Evropský dům v Brně v likvidaci
- Extinction Rebellion Czech Republic - Rebelie proti vyhynutí, z.s.
- Erasmus Gathering, z.s.
- E-sdílej, z. s.
- EKOFEST z.s.
- EVA&TOM z.s.
- Eligius z.s.
- Edvard na Hrad, z.s.
- EDUKATIVNÍ SPOLEČNOST, z.s. v likvidaci
- Ex cinere 1119, z.s.
- eDELTA, z.s.
- Eurostudy v likvidaci
- ENDURO PROSTĚJOV, z.s.
- EvetData, z. s.
- ENERKOM Plzeňsko, z.s.
- Eurorestart z.s.
- Extreme cycling klub Třinec
- Ekologické sdružení pro ochranu vzácné fauny a flóry v katastrálním území Rokytno, o.s. v likvidaci
- EXPEDITION TEAM, z.s.
- Entreumists, z.s.
- ETERNITY
- Ekwo Club
- ELBERETH ROCK
- Energetické společenství domů Brněnská 24, 26, 28 a 30 v Plzni, z. s.
- Erteple a Hmla, z.s.
- EURO racing team z. s.