- Edo Union, Czech Republic
- EDUmix, z.s.
- Euro Queer Edu Czech Republic, z.s.
- Edukuj, z.s.
- Ecoinstitut, z.s.
- ERA - European Rescue Academy z.s.
- EDUM, z.s.
- Educationem pro prosperitas o. s.
- Expertní komora kariérového poradenství, z.s.
- Ekoagro-Krajina o.s.
- EVROPSKÁ KOMISE PRO MIGRACI,AZYL,INTEGRACI,OCHRANU PRÁV CIZINCŮ A NÁRODNOSTNÍCH MENŠIN,o.s. v likvidaci
- Envi-Net
- EXTRÉMNÍ SPORTY z.s.
- Entreumists, z.s.
- EKO KRAJINA, občanské sdružení
- Ekocentrum Fryčkovna
- EUNOMIE
- European Media Professionals, o.s.
- ENTOG CZ z.s.
- Eppas z.s.
- Ekologické sdružení pro zdravé životní prostředí v likvidaci
- EURO CLUB MASTRONARDI
- Ecological Solutions, z.s.
- E Bodyvital, o.s. "v likvidaci"
- ECOLOGICA GABRETA
- Elektrica Musica z. s.
- Extraliga do Brna! v likvidaci
- eD Sport Team, z. s.
- ECOExchange, z.s.
- Ellsa, z.s.
- Ekologické sdružení AGARA
- Ex cinere 1119, z.s.
- EnCare, z. s.
- E-koruna z. s.
- European Network for Financial Education, z. s. v likvidaci
- EUROROMA o.s.
- Everyday Saturday, z.s.
- ENERGY JUDO TEAM, z.s.
- Ekoforum pánevní oblasti Severních Čech
- ELTRAV CZ 2013 v likvidaci
- eMOTION Powerlifting Plzeň z.s.
- EKO centrum Srdov
- EU a My „50 ”
- European Center for Civic Initiatives, z. s.
- Equican Českomoravské sdružení pro hipo-canis terapie v likvidaci
- Evropský výbor pro prevenci kriminality a násilné trestné činnosti z.s.
- Europan - CZ, zapsaný spolek
- EcoNet CENTRUM
- Ethio-Czech Community z.s.
- Evropská arbitráž, o.s.