- ETTA CLUB - klub sběratelů pivních suvenýrů a historie pivovarnictví
- Edufundraiser, z.s., v likvidaci
- Element, o.s.
- ELIPSA - letecký klub - občanské sdružení - Letecké amatérské asociace České republiky Česká Lípa
- Every Day Tuning Club, o. s.
- Evropské centrum pro mithraistická studia, z.s.
- edu solution z.s.
- Elektrotechnický svaz český, z. s.
- European Consulting & Service International z.s.
- ENDO Talks CZ, z. s.
- Euro Garancia, sociálně ekonomické společenství v likvidaci
- Exotický Ráj Foundation z.s.
- EKKO, Jablonec nad Nisou
- E-commerce & Tech cluster, z.s.
- Ekologické sdružení soukromě hospodárných rolníků a podnikatelů okresů Havlíčkův Brod a Žďár nad Sázavou v likvidaci
- Experti na dluhy, o.s.
- Evropská letecká liga z.s.
- ÉRA sport Litomyšl
- Elánek pro rodinu, z.s.
- EKO Průhonice v likvidaci
- ELEKTROTECHNICKÉ ŽIVNOSTENSKÉ SPOLEČENSTVO Brno-město, Brno-venkov - v likvidaci
- ENERGY CENTRE ČESKÉ BUDĚJOVICE, z.s.
- EVROPSKÁ ASOCIACE LEKTORŮ EOV - VEOVISION z.s.
- Ekologické sdružení pro ochranu vzácné fauny a flóry v katastrálním území Rokytno, o.s. v likvidaci
- EFEKT DANCE BRNO, z.s.
- EDU-ART PRAHA
- EDUSKI Česká republika z.s.
- ENERGOKLASTR, z.s.
- Evropská platforma, z. s.
- Educenter Komunita Praha 5 z.s.
- EmaDry, z. s.
- EXLIBRIS, spolek přátel umění
- ENSEMBLE MARTINŮ, z.s.
- EULOW.NET
- English Learning Centre o.s. v likvidaci
- Envi-Net
- EKO - Proskovice
- Ekospolek Vysočina z.s.
- Eiendom z.s.
- EkoTOZ o.s.
- Elefuntidino z.s.
- Ernestina v likvidaci
- ELITE HOCKEY z.s.
- EUREDA o.s.
- European Council of Autistic People z. s.
- Ekocentrum BESKYDY
- EURION, z.s.
- EDUCOS o.s.
- Emily4Life, z. s.
- ERÍNYE v likvidaci