- Equisport Čeladná z.s.
- Educa Optima , z.s.
- Europen Agency for Cooperation and Development "v likvidaci"
- EMSOC z.s., v likvidaci
- Extreme Dogs, z.s.
- Evelínka, z. s.
- ENDO Talks CZ, z. s.
- Ernest Rascal
- EUSIS - EUROPE START - UP - IMMIGRANT, o.s.
- EquiStable Korycany, z.s.
- EKOFORUM 2001
- Evropské sdružení zvířecích útulků, o.s. v likvidaci
- EuroPartner
- EUNE
- Expedice Evropa z.s.
- Ekologický bod, z.s.
- Expert racing team z. s.
- ÉRA ŽEN, z.s. v likvidaci
- Ecce Homo Šternberk, z.s.
- Equiklub Slavošov
- EKOENERGOREGION
- Europa UOMO CZ, z.s. - v likvidaci
- Element Karlovka z. s.
- EnviKlub HURÁ VEN, z.s.
- European People & Media z.s.
- EVROPSKÁ UNIVERSITA v likvidaci
- Elab team, z.s.
- Emerik Blum, z.s.
- Euro-iránské centrum obchodního rozvoje, z.s.
- Europeans, z.s.
- Energie pro všechny
- Eminere, z. s.
- Energetické společenství domů Brněnská 24, 26, 28 a 30 v Plzni, z. s.
- ETIKA V CHOVECH
- Expedial
- EKONAUT o.s.
- European town development, o.s.
- Evropská platforma, z. s.
- Environmentální chování odpovědné společnosti - ECHOS, z. s. v likvidaci
- Epistea, z. s.
- EURO PRAGENSIS ARS v likvidaci
- Ekocentrum Poustka z. s.
- Envibor, z. s.
- EVELÍNA o.s.
- Equiteam Mersi, z. s.
- Energie pyramidy z.s.
- EuroDog Praha v likvidaci
- ESSENTIAL CLUB
- Eurostudy v likvidaci
- Elánek KIDS z.s.