- Elišáček z.s.
- EXTRALIGA MASTERS, spolek
- Erudik z.s.
- EUSIS - EUROPE START - UP - IMMIGRANT, o.s.
- Energis 24
- Ekologická multimedia v likvidaci
- EduShield, z. s.
- Esthete author z.s.
- Evropské centrum pantomimy neslyšících, z.s.
- ÉRA sport Litomyšl
- Equisport Čeladná z.s.
- EUROPEAN MEDIA ASSOCIATION,o.s.
- Energy Healing Therapy z.s.
- eDELTA, z.s.
- El Fumador, z.s.
- EDYMAX fight club
- EQUITY CZECH "v likvidaci"
- Educa Corcontica, z.s.
- Ensó, z. s.
- Eduspicer z. s.
- Ekonomická společnost Masarykovy university v likvidaci
- Elektrotechnický cech Morava - jih
- Excalibur
- ELATER v likvidaci
- Elab team, z.s.
- Epochal Dances z.s.
- Euro Queer Edu Czech Republic, z.s.
- Euroregion Šumava - jihozápadní Čechy, z. s.
- Ekologické sdružení Pořežín v likvidaci
- EPO1, z.s.
- Ekologické Sdružení Občanů Stodůlek a Řeporyj, v likvidaci
- Entre Sociale z.s.
- Erudio Natura o. s.
- EuroClaim Consulting, o.s., v likvidaci
- Educatis, z.s.
- Etnica Spolek
- EDU FOR YOU, z. s.
- EURODÉFENSE CZ z.s. v likvidaci
- Erasmus Student Network Ústí nad Labem, z.s.
- Erasmus Student Network MUNI Brno, z. s.
- EXTREM TEAM VYSTRKOV, o.s.
- EVOPS, spolek
- Elsyst FC
- EUROPEANCLUB
- Ekoforum Štěkeňsko
- Elite Fitness Kladno, z.s.
- E-sdílej, z. s.
- Evropská komora vzájemné spolupráce, z. s.
- Ekokul z.s.
- Evropský klub