- Ensó, z. s.
- English Speaking Union, o.s. v likvidaci
- Energetická komunita SVATOJIŘSKÝ LES, z.s.
- EXTREME SPORTS CLUB Borová v likvidaci
- EUROPROSPECT z. s.
- Energy Healing Therapy z.s.
- EMBAYA o.s.
- EducationTalentCulture, z.s.
- European Medical Phototherapy and Esthetics Association, z.s.
- ECCE HOMO v likvidaci
- ESN Hradec Králové z.s.
- EUSIS - EUROPE START - UP - IMMIGRANT, o.s.
- Elbiana z.s.
- expert KING PINS z.s.
- Evropský svaz pro obec a malá města-ECOVAST v likvidaci
- East-West-Film club v likvidaci
- Emergency game z. s.
- Emmaus Praha v likvidaci
- EURO AUTO CLUB, z.s.
- EUROČÍNSKÁ ASOCIACE, z.s.
- EKOGEN, o.s.
- EPIMELEIA.SK, z.s.
- ESKYMO sport & travel, z.s.
- ECOPOLIT, o.s.
- Estrela verde
- ESTAMOS BEM, z.s.
- eLaborka, z. s.
- ELKA Ostrava z.s.
- etc. galerie z. s.
- Exodus v likvidaci
- Expedice žití z.s.
- East Tennis Club spolek
- EQUILION z.s.
- European Educational Cannabis Clinic, z.s.
- Ekologické sdružení pro ochranu vzácné fauny a flóry v katastrálním území Rokytno, o.s. v likvidaci
- Extreme Wheels Rožnov, z.s.
- Educa Forum z.s.
- Evropská unie z.s.
- Eiendom z.s.
- ENERKOM Opavsko, z.s.
- EVA&TOM z.s.
- Etango z.s.
- ESO 98
- Evoluce - Jihočeské centrum českého znakového jazyka z.s.
- Eurasier Klub z.s.
- Evropské regiony
- EQUI KLUB PASTUCHOVICE, z.s.
- ERMITÁŽ MATAL
- Ekologické sdružení pro zdravé životní prostředí v likvidaci
- ELIM Pardubice, křesťanská společnost pro diakonii, z. s.