- Ecce Euro Educa na pomoc osobám sociálně potřebným,osobám s různými
- EMDR Česká republika z.s.
- European Science and Art Publishing, z.s.
- Energis 24
- EGLSEE
- Energetické společenství pro Triangle, z.s. v likvidaci
- Egerland sled dogs
- Equilibrio, z. s.
- El Fumador, z.s.
- E-commerce & Tech cluster, z.s.
- Elíšek, z.s.
- EduArt z. s.
- EURODÉFENSE CZ z.s. v likvidaci
- E - line
- Eucleia, z. s.
- Ekoagro-Krajina o.s.
- ELAIA z.s.
- Evropské společenství Slovanů sv.Cyrila a Metoděje v likvidaci
- Evropský institut pro udržitelný rozvoj, z.s.
- EQUUS-SPORT-SYSTEM
- Equita Therapy z.s.
- Excellence Cigar Club z.s.
- Educa Socio House z.s.
- Endurová Škola, z.s.
- ECOBLUEPORT o.s.
- Enagram, z.s. - v likvidaci
- E-centrum, o. s.
- Emergency Logistics Ambassadors z. s.
- Elpizo z.s.
- ETERNITY
- Ekologické sdružení pro zdravé životní prostředí obce Konojedy, o.s.
- Equi-Help Dobříš z.s.
- Évadées z.s.
- EPICentrum-Strakonice z.s.
- EkoPULA
- EPIMELEIA.SK, z.s.
- EXTREME RACING TEAM HNĚVKOVICE, z.s.
- EUROČÍNSKÁ ASOCIACE, z.s.
- EXPEDITION CAMERA CLUB, Z. S.
- E.H security kick-box gym, z.s.
- European Hotels Association, z.s.
- EURYTMIE, z. s.
- Erasmus Student Network Česká republika z. s.
- Equiteam Doloplazy, z.s.
- Euro Capital Association, o.s.
- Effatha, z.s.
- EMERGENCY sdružení profesních zdravotníků, z. s.
- Ekocentrum Příbram z.s.
- Enliven Centre, z.s.
- ENVIA "v likvidaci"