- IN DUBIO PRO REO, o.s.
- Informační centrum veřejného sektoru v likvidaci
- IUS INFINITUM z.s.
- IHE Czech Republic, z.s.
- Institut analytických studií - IAS
- IHC Chemipro Chrudim z.s.
- INVOSERVIS Brno, v likvidaci
- Institut terezínských skladatelů, z.s.
- Internacionální Federace Bobbingu "v likvidaci"
- Indigo o.s.
- Inline Skating Club Praha z.s.
- Information & Playing Club v likvidaci
- I-KOS z. s.
- Institut Ambassador z.s.
- ISCA z.s.
- IURI AUGENDO
- Idea Boom, o.s.
- iv 1210, z.s.
- Institut zážitkové pedagogiky
- ISP net consulting, o.s.
- Informační centrum prevence a boje proti AIDS Prostějov v likvidaci
- Institut mezioborových studií, spolek v likvidaci
- International Society for Stereology & Image Analysis, z. s.
- INDONÉSKO-ČESKÁ OBCHODNÍ A KULTURNÍ KOMORA, z.s.
- Inovacentrum Brno, z.s.
- Institut pro studium kultury a etnocentrismu
- Iuridicum Remedium, z. s.
- INNEBANDY Klub Praha v likvidaci
- International Opportunities, o. s.
- Informační média Česká Republika, z. s. v likvidaci
- I love Olomouc
- Institut úzkosti z.s.
- Iniciativa pro efektivní zdravotnictví, z.s.
- INVEST IN BRAVERY GLOBAL z.s.
- ianus v likvidaci
- In-Line hokejový klub Outsiders Pardubice o.s.
- INDEPENDENT, o.s.
- International Society for Glucan Research, z.s. v likvidaci
- Internetová komunikace, o.s.
- IGNT projekt z.s.
- Indiánský klub Vlčí totem
- IPMS Krkonoše z.s.
- Imperativ
- ITS Tennis Club, z.s.
- IRENE z.s.
- Institut film a společnost z.s.
- INTUITIVNÍ PEDAGOGIKA z.s.
- Inspirace - občanské sdružení pro rozvoj kultury a ZUŠ v Jablonci nad Jizerou v likvidaci
- iDobříšsko.cz, z. s.
- Islám v České republice nechceme v likvidaci