- Elektroretro z.s.
- EDU-SCHOOL CONSULTANT, z. s.
- EU spol. na ochranu práv občanů
- EURACHEM-ČR z.s.
- Exotický Ráj Foundation z.s.
- EVA
- EuroHash Praha, z. s.
- EDUFUN, z.s.
- EWTO Česká republika, z.s.
- EPIC Sport Šternberk, z.s.
- Evropská akademie přírodní a holistické medicíny
- Ekologický spolek Horní Bříza, z.s.
- ENERKOM Moštěnka, z.s.
- EQUIT&T z.s.
- EUROBURZA
- EUTERPE, z.s.
- Extraliga do Brna! v likvidaci
- EKO-CENTRUM Pidi Midi z.s.
- Evropa doma z.s.
- EH racing, z.s.
- Edukační spolek při Střední zdravotnické škole v Opavě
- ERUDIO CZ, z. s.
- Ef osm z.s.
- ELON, o. s.
- EMPATHY
- Evropa zblízka o.s.
- Esoterická společnost Hermetigon
- European Ice School z.s. v likvidaci
- Evropsko-Ázerbajdžánská obchodní komora z.s.
- Erudik z.s.
- Ekocentrum Prácheňska
- Evropské centrum mládeže Břeclav/European Youth Centre Břeclav z. s.
- Ekokoridor
- EarthLab z.s.
- Educent z.s.
- EquiTeam, CZ v likvidaci
- ENERKOM Brána Brněnska z.s.
- Energetické společenství domů Brněnská 24, 26, 28 a 30 v Plzni, z. s.
- EKOFÓRUM spolek
- EUROPEAN JOINT VENTURES O.S. v likvidaci
- ELATER v likvidaci
- ESN UCT Prague, z.s.
- EARTHLINKS, v likvidaci
- Entre, o.s.
- Evropské centrum sociální a bezpečnostní výchovy, z. s.
- European Summer Program on Rationality, z. s.
- Evropská unie pro lidská práva, z.s.
- Explosiw Bike Team
- ENVIRA v likvidaci
- ELBERETH ROCK